Protein–RNA interactions for Protein: Q96PE5

OPALIN, Opalin, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPALINQ96PE5 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
OPALINQ96PE5 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
OPALINQ96PE5 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
OPALINQ96PE5 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
OPALINQ96PE5 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
OPALINQ96PE5 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
OPALINQ96PE5 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
OPALINQ96PE5 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
OPALINQ96PE5 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
OPALINQ96PE5 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
OPALINQ96PE5 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
OPALINQ96PE5 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
OPALINQ96PE5 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
OPALINQ96PE5 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
OPALINQ96PE5 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
OPALINQ96PE5 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
OPALINQ96PE5 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
OPALINQ96PE5 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
OPALINQ96PE5 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
OPALINQ96PE5 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
OPALINQ96PE5 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
OPALINQ96PE5 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
OPALINQ96PE5 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
OPALINQ96PE5 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
OPALINQ96PE5 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
OPALINQ96PE5 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
OPALINQ96PE5 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
OPALINQ96PE5 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
OPALINQ96PE5 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
OPALINQ96PE5 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
OPALINQ96PE5 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
OPALINQ96PE5 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
OPALINQ96PE5 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
OPALINQ96PE5 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
OPALINQ96PE5 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
OPALINQ96PE5 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
OPALINQ96PE5 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
OPALINQ96PE5 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
OPALINQ96PE5 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
OPALINQ96PE5 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
OPALINQ96PE5 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
OPALINQ96PE5 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
OPALINQ96PE5 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
OPALINQ96PE5 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
OPALINQ96PE5 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
OPALINQ96PE5 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
OPALINQ96PE5 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
OPALINQ96PE5 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
OPALINQ96PE5 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
OPALINQ96PE5 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
OPALINQ96PE5 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
OPALINQ96PE5 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
OPALINQ96PE5 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
OPALINQ96PE5 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
OPALINQ96PE5 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
OPALINQ96PE5 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
OPALINQ96PE5 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
OPALINQ96PE5 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
OPALINQ96PE5 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
OPALINQ96PE5 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
OPALINQ96PE5 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
OPALINQ96PE5 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
OPALINQ96PE5 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
OPALINQ96PE5 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
OPALINQ96PE5 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
OPALINQ96PE5 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
OPALINQ96PE5 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
OPALINQ96PE5 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
OPALINQ96PE5 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
OPALINQ96PE5 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
OPALINQ96PE5 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
OPALINQ96PE5 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
OPALINQ96PE5 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
OPALINQ96PE5 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
OPALINQ96PE5 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
OPALINQ96PE5 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
OPALINQ96PE5 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
OPALINQ96PE5 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
OPALINQ96PE5 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
OPALINQ96PE5 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
OPALINQ96PE5 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
OPALINQ96PE5 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
OPALINQ96PE5 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
OPALINQ96PE5 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
OPALINQ96PE5 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
OPALINQ96PE5 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
OPALINQ96PE5 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
OPALINQ96PE5 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
OPALINQ96PE5 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
OPALINQ96PE5 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
OPALINQ96PE5 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
OPALINQ96PE5 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
OPALINQ96PE5 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
OPALINQ96PE5 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
OPALINQ96PE5 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
OPALINQ96PE5 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
OPALINQ96PE5 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
OPALINQ96PE5 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
OPALINQ96PE5 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
OPALINQ96PE5 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms