Protein–RNA interactions for Protein: Q96M42

LINC00479, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00479, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00479Q96M42 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LINC00479Q96M42 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
LINC00479Q96M42 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LINC00479Q96M42 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LINC00479Q96M42 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LINC00479Q96M42 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LINC00479Q96M42 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LINC00479Q96M42 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LINC00479Q96M42 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LINC00479Q96M42 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LINC00479Q96M42 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LINC00479Q96M42 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LINC00479Q96M42 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LINC00479Q96M42 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LINC00479Q96M42 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LINC00479Q96M42 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LINC00479Q96M42 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LINC00479Q96M42 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LINC00479Q96M42 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LINC00479Q96M42 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LINC00479Q96M42 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LINC00479Q96M42 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LINC00479Q96M42 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LINC00479Q96M42 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LINC00479Q96M42 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LINC00479Q96M42 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LINC00479Q96M42 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LINC00479Q96M42 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
LINC00479Q96M42 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LINC00479Q96M42 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LINC00479Q96M42 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LINC00479Q96M42 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
LINC00479Q96M42 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
LINC00479Q96M42 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LINC00479Q96M42 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LINC00479Q96M42 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LINC00479Q96M42 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LINC00479Q96M42 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LINC00479Q96M42 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LINC00479Q96M42 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
LINC00479Q96M42 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LINC00479Q96M42 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LINC00479Q96M42 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LINC00479Q96M42 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LINC00479Q96M42 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LINC00479Q96M42 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LINC00479Q96M42 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
LINC00479Q96M42 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LINC00479Q96M42 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LINC00479Q96M42 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LINC00479Q96M42 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LINC00479Q96M42 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
LINC00479Q96M42 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
LINC00479Q96M42 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LINC00479Q96M42 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
LINC00479Q96M42 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
LINC00479Q96M42 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
LINC00479Q96M42 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LINC00479Q96M42 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LINC00479Q96M42 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LINC00479Q96M42 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
LINC00479Q96M42 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
LINC00479Q96M42 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
LINC00479Q96M42 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LINC00479Q96M42 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LINC00479Q96M42 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
LINC00479Q96M42 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LINC00479Q96M42 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
LINC00479Q96M42 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
LINC00479Q96M42 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
LINC00479Q96M42 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
LINC00479Q96M42 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
LINC00479Q96M42 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
LINC00479Q96M42 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
LINC00479Q96M42 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
LINC00479Q96M42 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
LINC00479Q96M42 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
LINC00479Q96M42 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LINC00479Q96M42 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
LINC00479Q96M42 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
LINC00479Q96M42 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
LINC00479Q96M42 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
LINC00479Q96M42 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
LINC00479Q96M42 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
LINC00479Q96M42 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
LINC00479Q96M42 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LINC00479Q96M42 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LINC00479Q96M42 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LINC00479Q96M42 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LINC00479Q96M42 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
LINC00479Q96M42 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
LINC00479Q96M42 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
LINC00479Q96M42 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
LINC00479Q96M42 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LINC00479Q96M42 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LINC00479Q96M42 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
LINC00479Q96M42 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
LINC00479Q96M42 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
LINC00479Q96M42 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
LINC00479Q96M42 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.6 ms