Protein–RNA interactions for Protein: Q96E29

MTERF3, Transcription termination factor 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTERF3Q96E29 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
MTERF3Q96E29 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
MTERF3Q96E29 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
MTERF3Q96E29 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
MTERF3Q96E29 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
MTERF3Q96E29 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
MTERF3Q96E29 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
MTERF3Q96E29 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
MTERF3Q96E29 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
MTERF3Q96E29 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
MTERF3Q96E29 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
MTERF3Q96E29 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
MTERF3Q96E29 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
MTERF3Q96E29 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
MTERF3Q96E29 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
MTERF3Q96E29 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
MTERF3Q96E29 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
MTERF3Q96E29 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
MTERF3Q96E29 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
MTERF3Q96E29 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
MTERF3Q96E29 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
MTERF3Q96E29 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
MTERF3Q96E29 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
MTERF3Q96E29 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
MTERF3Q96E29 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
MTERF3Q96E29 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
MTERF3Q96E29 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
MTERF3Q96E29 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
MTERF3Q96E29 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
MTERF3Q96E29 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
MTERF3Q96E29 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
MTERF3Q96E29 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
MTERF3Q96E29 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
MTERF3Q96E29 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MTERF3Q96E29 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MTERF3Q96E29 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MTERF3Q96E29 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MTERF3Q96E29 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MTERF3Q96E29 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MTERF3Q96E29 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MTERF3Q96E29 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
MTERF3Q96E29 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
MTERF3Q96E29 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
MTERF3Q96E29 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MTERF3Q96E29 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
MTERF3Q96E29 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
MTERF3Q96E29 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
MTERF3Q96E29 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MTERF3Q96E29 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
MTERF3Q96E29 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
MTERF3Q96E29 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MTERF3Q96E29 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
MTERF3Q96E29 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
MTERF3Q96E29 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
MTERF3Q96E29 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
MTERF3Q96E29 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
MTERF3Q96E29 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MTERF3Q96E29 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
MTERF3Q96E29 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MTERF3Q96E29 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
MTERF3Q96E29 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MTERF3Q96E29 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MTERF3Q96E29 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
MTERF3Q96E29 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MTERF3Q96E29 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MTERF3Q96E29 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MTERF3Q96E29 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MTERF3Q96E29 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MTERF3Q96E29 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MTERF3Q96E29 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MTERF3Q96E29 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
MTERF3Q96E29 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MTERF3Q96E29 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
MTERF3Q96E29 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MTERF3Q96E29 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MTERF3Q96E29 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MTERF3Q96E29 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MTERF3Q96E29 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MTERF3Q96E29 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
MTERF3Q96E29 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
MTERF3Q96E29 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MTERF3Q96E29 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MTERF3Q96E29 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MTERF3Q96E29 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MTERF3Q96E29 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MTERF3Q96E29 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MTERF3Q96E29 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MTERF3Q96E29 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MTERF3Q96E29 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
MTERF3Q96E29 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
MTERF3Q96E29 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
MTERF3Q96E29 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
MTERF3Q96E29 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
MTERF3Q96E29 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.72
MTERF3Q96E29 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MTERF3Q96E29 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
MTERF3Q96E29 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
MTERF3Q96E29 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MTERF3Q96E29 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MTERF3Q96E29 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms