Protein–RNA interactions for Protein: Q92572

AP3S1, AP-3 complex subunit sigma-1, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3S1Q92572 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
AP3S1Q92572 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
AP3S1Q92572 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
AP3S1Q92572 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
AP3S1Q92572 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
AP3S1Q92572 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
AP3S1Q92572 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
AP3S1Q92572 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
AP3S1Q92572 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
AP3S1Q92572 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
AP3S1Q92572 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
AP3S1Q92572 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
AP3S1Q92572 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
AP3S1Q92572 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
AP3S1Q92572 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
AP3S1Q92572 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
AP3S1Q92572 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
AP3S1Q92572 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
AP3S1Q92572 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
AP3S1Q92572 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
AP3S1Q92572 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
AP3S1Q92572 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
AP3S1Q92572 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
AP3S1Q92572 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
AP3S1Q92572 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
AP3S1Q92572 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
AP3S1Q92572 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
AP3S1Q92572 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
AP3S1Q92572 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
AP3S1Q92572 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
AP3S1Q92572 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
AP3S1Q92572 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
AP3S1Q92572 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
AP3S1Q92572 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
AP3S1Q92572 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
AP3S1Q92572 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
AP3S1Q92572 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
AP3S1Q92572 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
AP3S1Q92572 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
AP3S1Q92572 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
AP3S1Q92572 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
AP3S1Q92572 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
AP3S1Q92572 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
AP3S1Q92572 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
AP3S1Q92572 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
AP3S1Q92572 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
AP3S1Q92572 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
AP3S1Q92572 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
AP3S1Q92572 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
AP3S1Q92572 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
AP3S1Q92572 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
AP3S1Q92572 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
AP3S1Q92572 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
AP3S1Q92572 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
AP3S1Q92572 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
AP3S1Q92572 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
AP3S1Q92572 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
AP3S1Q92572 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
AP3S1Q92572 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
AP3S1Q92572 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
AP3S1Q92572 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
AP3S1Q92572 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
AP3S1Q92572 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
AP3S1Q92572 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
AP3S1Q92572 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
AP3S1Q92572 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
AP3S1Q92572 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
AP3S1Q92572 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
AP3S1Q92572 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
AP3S1Q92572 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
AP3S1Q92572 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
AP3S1Q92572 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
AP3S1Q92572 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
AP3S1Q92572 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
AP3S1Q92572 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
AP3S1Q92572 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
AP3S1Q92572 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
AP3S1Q92572 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
AP3S1Q92572 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
AP3S1Q92572 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
AP3S1Q92572 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
AP3S1Q92572 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
AP3S1Q92572 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
AP3S1Q92572 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
AP3S1Q92572 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
AP3S1Q92572 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
AP3S1Q92572 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
AP3S1Q92572 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
AP3S1Q92572 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
AP3S1Q92572 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
AP3S1Q92572 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
AP3S1Q92572 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
AP3S1Q92572 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
AP3S1Q92572 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
AP3S1Q92572 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
AP3S1Q92572 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
AP3S1Q92572 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
AP3S1Q92572 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
AP3S1Q92572 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
AP3S1Q92572 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms