Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWY6

MBD3L1, Methyl-CpG-binding domain protein 3-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD3L1Q8WWY6 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MBD3L1Q8WWY6 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MBD3L1Q8WWY6 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MBD3L1Q8WWY6 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
MBD3L1Q8WWY6 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MBD3L1Q8WWY6 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MBD3L1Q8WWY6 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MBD3L1Q8WWY6 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MBD3L1Q8WWY6 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MBD3L1Q8WWY6 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MBD3L1Q8WWY6 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MBD3L1Q8WWY6 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MBD3L1Q8WWY6 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MBD3L1Q8WWY6 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MBD3L1Q8WWY6 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MBD3L1Q8WWY6 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MBD3L1Q8WWY6 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MBD3L1Q8WWY6 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MBD3L1Q8WWY6 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MBD3L1Q8WWY6 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MBD3L1Q8WWY6 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MBD3L1Q8WWY6 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MBD3L1Q8WWY6 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MBD3L1Q8WWY6 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MBD3L1Q8WWY6 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MBD3L1Q8WWY6 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MBD3L1Q8WWY6 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MBD3L1Q8WWY6 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MBD3L1Q8WWY6 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MBD3L1Q8WWY6 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MBD3L1Q8WWY6 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MBD3L1Q8WWY6 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MBD3L1Q8WWY6 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MBD3L1Q8WWY6 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MBD3L1Q8WWY6 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MBD3L1Q8WWY6 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MBD3L1Q8WWY6 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MBD3L1Q8WWY6 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MBD3L1Q8WWY6 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MBD3L1Q8WWY6 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MBD3L1Q8WWY6 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MBD3L1Q8WWY6 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MBD3L1Q8WWY6 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MBD3L1Q8WWY6 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MBD3L1Q8WWY6 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MBD3L1Q8WWY6 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MBD3L1Q8WWY6 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MBD3L1Q8WWY6 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MBD3L1Q8WWY6 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MBD3L1Q8WWY6 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MBD3L1Q8WWY6 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MBD3L1Q8WWY6 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MBD3L1Q8WWY6 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MBD3L1Q8WWY6 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MBD3L1Q8WWY6 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MBD3L1Q8WWY6 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MBD3L1Q8WWY6 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MBD3L1Q8WWY6 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MBD3L1Q8WWY6 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MBD3L1Q8WWY6 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MBD3L1Q8WWY6 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
MBD3L1Q8WWY6 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MBD3L1Q8WWY6 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MBD3L1Q8WWY6 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MBD3L1Q8WWY6 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
MBD3L1Q8WWY6 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MBD3L1Q8WWY6 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MBD3L1Q8WWY6 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MBD3L1Q8WWY6 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MBD3L1Q8WWY6 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MBD3L1Q8WWY6 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MBD3L1Q8WWY6 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MBD3L1Q8WWY6 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MBD3L1Q8WWY6 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MBD3L1Q8WWY6 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MBD3L1Q8WWY6 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MBD3L1Q8WWY6 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MBD3L1Q8WWY6 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MBD3L1Q8WWY6 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
MBD3L1Q8WWY6 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MBD3L1Q8WWY6 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MBD3L1Q8WWY6 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MBD3L1Q8WWY6 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MBD3L1Q8WWY6 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MBD3L1Q8WWY6 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MBD3L1Q8WWY6 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MBD3L1Q8WWY6 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MBD3L1Q8WWY6 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MBD3L1Q8WWY6 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MBD3L1Q8WWY6 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MBD3L1Q8WWY6 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MBD3L1Q8WWY6 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MBD3L1Q8WWY6 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MBD3L1Q8WWY6 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MBD3L1Q8WWY6 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MBD3L1Q8WWY6 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MBD3L1Q8WWY6 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MBD3L1Q8WWY6 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MBD3L1Q8WWY6 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MBD3L1Q8WWY6 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms