Protein–RNA interactions for Protein: Q8TC41

RNF217, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF217, humanhuman

Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF217Q8TC41 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RNF217Q8TC41 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RNF217Q8TC41 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RNF217Q8TC41 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RNF217Q8TC41 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RNF217Q8TC41 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RNF217Q8TC41 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RNF217Q8TC41 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RNF217Q8TC41 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RNF217Q8TC41 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RNF217Q8TC41 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RNF217Q8TC41 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RNF217Q8TC41 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RNF217Q8TC41 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RNF217Q8TC41 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RNF217Q8TC41 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RNF217Q8TC41 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RNF217Q8TC41 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RNF217Q8TC41 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RNF217Q8TC41 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RNF217Q8TC41 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RNF217Q8TC41 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RNF217Q8TC41 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RNF217Q8TC41 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RNF217Q8TC41 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RNF217Q8TC41 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RNF217Q8TC41 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RNF217Q8TC41 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RNF217Q8TC41 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
RNF217Q8TC41 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RNF217Q8TC41 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RNF217Q8TC41 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RNF217Q8TC41 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RNF217Q8TC41 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
RNF217Q8TC41 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RNF217Q8TC41 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RNF217Q8TC41 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RNF217Q8TC41 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RNF217Q8TC41 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RNF217Q8TC41 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RNF217Q8TC41 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RNF217Q8TC41 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RNF217Q8TC41 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RNF217Q8TC41 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RNF217Q8TC41 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RNF217Q8TC41 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RNF217Q8TC41 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RNF217Q8TC41 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RNF217Q8TC41 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RNF217Q8TC41 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RNF217Q8TC41 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RNF217Q8TC41 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RNF217Q8TC41 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RNF217Q8TC41 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RNF217Q8TC41 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RNF217Q8TC41 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RNF217Q8TC41 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
RNF217Q8TC41 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RNF217Q8TC41 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RNF217Q8TC41 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
RNF217Q8TC41 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RNF217Q8TC41 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RNF217Q8TC41 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RNF217Q8TC41 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RNF217Q8TC41 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RNF217Q8TC41 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RNF217Q8TC41 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RNF217Q8TC41 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RNF217Q8TC41 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RNF217Q8TC41 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RNF217Q8TC41 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RNF217Q8TC41 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RNF217Q8TC41 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RNF217Q8TC41 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RNF217Q8TC41 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RNF217Q8TC41 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RNF217Q8TC41 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RNF217Q8TC41 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RNF217Q8TC41 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RNF217Q8TC41 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RNF217Q8TC41 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RNF217Q8TC41 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RNF217Q8TC41 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RNF217Q8TC41 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RNF217Q8TC41 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RNF217Q8TC41 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RNF217Q8TC41 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RNF217Q8TC41 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RNF217Q8TC41 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RNF217Q8TC41 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RNF217Q8TC41 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RNF217Q8TC41 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RNF217Q8TC41 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RNF217Q8TC41 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RNF217Q8TC41 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RNF217Q8TC41 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RNF217Q8TC41 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RNF217Q8TC41 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RNF217Q8TC41 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RNF217Q8TC41 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms