Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z398

ZNF550, Zinc finger protein 550, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF550Q7Z398 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZNF550Q7Z398 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZNF550Q7Z398 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZNF550Q7Z398 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZNF550Q7Z398 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZNF550Q7Z398 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZNF550Q7Z398 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZNF550Q7Z398 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZNF550Q7Z398 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZNF550Q7Z398 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZNF550Q7Z398 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZNF550Q7Z398 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZNF550Q7Z398 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZNF550Q7Z398 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZNF550Q7Z398 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZNF550Q7Z398 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZNF550Q7Z398 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ZNF550Q7Z398 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZNF550Q7Z398 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZNF550Q7Z398 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZNF550Q7Z398 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZNF550Q7Z398 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZNF550Q7Z398 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZNF550Q7Z398 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
ZNF550Q7Z398 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZNF550Q7Z398 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZNF550Q7Z398 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZNF550Q7Z398 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZNF550Q7Z398 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZNF550Q7Z398 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZNF550Q7Z398 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZNF550Q7Z398 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZNF550Q7Z398 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZNF550Q7Z398 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZNF550Q7Z398 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZNF550Q7Z398 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZNF550Q7Z398 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZNF550Q7Z398 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZNF550Q7Z398 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZNF550Q7Z398 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZNF550Q7Z398 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZNF550Q7Z398 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZNF550Q7Z398 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZNF550Q7Z398 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZNF550Q7Z398 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZNF550Q7Z398 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZNF550Q7Z398 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZNF550Q7Z398 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZNF550Q7Z398 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZNF550Q7Z398 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZNF550Q7Z398 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZNF550Q7Z398 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
ZNF550Q7Z398 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZNF550Q7Z398 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZNF550Q7Z398 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZNF550Q7Z398 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZNF550Q7Z398 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZNF550Q7Z398 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZNF550Q7Z398 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZNF550Q7Z398 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZNF550Q7Z398 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZNF550Q7Z398 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZNF550Q7Z398 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZNF550Q7Z398 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZNF550Q7Z398 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZNF550Q7Z398 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZNF550Q7Z398 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZNF550Q7Z398 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZNF550Q7Z398 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ZNF550Q7Z398 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ZNF550Q7Z398 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ZNF550Q7Z398 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZNF550Q7Z398 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZNF550Q7Z398 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZNF550Q7Z398 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZNF550Q7Z398 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ZNF550Q7Z398 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ZNF550Q7Z398 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZNF550Q7Z398 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZNF550Q7Z398 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZNF550Q7Z398 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZNF550Q7Z398 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZNF550Q7Z398 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZNF550Q7Z398 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZNF550Q7Z398 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZNF550Q7Z398 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZNF550Q7Z398 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZNF550Q7Z398 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZNF550Q7Z398 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZNF550Q7Z398 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ZNF550Q7Z398 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ZNF550Q7Z398 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ZNF550Q7Z398 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZNF550Q7Z398 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZNF550Q7Z398 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZNF550Q7Z398 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
ZNF550Q7Z398 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZNF550Q7Z398 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZNF550Q7Z398 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZNF550Q7Z398 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 158.1 ms