Protein–RNA interactions for Protein: Q6QEF8

CORO6, Coronin-6, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CORO6Q6QEF8 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CORO6Q6QEF8 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CORO6Q6QEF8 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CORO6Q6QEF8 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CORO6Q6QEF8 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CORO6Q6QEF8 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CORO6Q6QEF8 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CORO6Q6QEF8 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CORO6Q6QEF8 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CORO6Q6QEF8 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CORO6Q6QEF8 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CORO6Q6QEF8 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CORO6Q6QEF8 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CORO6Q6QEF8 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CORO6Q6QEF8 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CORO6Q6QEF8 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CORO6Q6QEF8 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CORO6Q6QEF8 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CORO6Q6QEF8 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CORO6Q6QEF8 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CORO6Q6QEF8 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CORO6Q6QEF8 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CORO6Q6QEF8 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CORO6Q6QEF8 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CORO6Q6QEF8 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CORO6Q6QEF8 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CORO6Q6QEF8 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CORO6Q6QEF8 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CORO6Q6QEF8 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CORO6Q6QEF8 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CORO6Q6QEF8 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CORO6Q6QEF8 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CORO6Q6QEF8 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CORO6Q6QEF8 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CORO6Q6QEF8 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CORO6Q6QEF8 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CORO6Q6QEF8 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CORO6Q6QEF8 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CORO6Q6QEF8 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CORO6Q6QEF8 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CORO6Q6QEF8 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CORO6Q6QEF8 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CORO6Q6QEF8 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CORO6Q6QEF8 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CORO6Q6QEF8 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CORO6Q6QEF8 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CORO6Q6QEF8 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CORO6Q6QEF8 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CORO6Q6QEF8 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CORO6Q6QEF8 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CORO6Q6QEF8 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CORO6Q6QEF8 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CORO6Q6QEF8 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CORO6Q6QEF8 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CORO6Q6QEF8 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CORO6Q6QEF8 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CORO6Q6QEF8 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CORO6Q6QEF8 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CORO6Q6QEF8 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CORO6Q6QEF8 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CORO6Q6QEF8 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CORO6Q6QEF8 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CORO6Q6QEF8 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CORO6Q6QEF8 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CORO6Q6QEF8 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CORO6Q6QEF8 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CORO6Q6QEF8 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CORO6Q6QEF8 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CORO6Q6QEF8 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CORO6Q6QEF8 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CORO6Q6QEF8 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CORO6Q6QEF8 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CORO6Q6QEF8 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CORO6Q6QEF8 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CORO6Q6QEF8 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CORO6Q6QEF8 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CORO6Q6QEF8 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CORO6Q6QEF8 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CORO6Q6QEF8 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CORO6Q6QEF8 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CORO6Q6QEF8 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CORO6Q6QEF8 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CORO6Q6QEF8 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CORO6Q6QEF8 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CORO6Q6QEF8 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CORO6Q6QEF8 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CORO6Q6QEF8 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CORO6Q6QEF8 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CORO6Q6QEF8 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CORO6Q6QEF8 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CORO6Q6QEF8 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CORO6Q6QEF8 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CORO6Q6QEF8 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CORO6Q6QEF8 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CORO6Q6QEF8 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CORO6Q6QEF8 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CORO6Q6QEF8 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CORO6Q6QEF8 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CORO6Q6QEF8 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CORO6Q6QEF8 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.4 ms