Protein–RNA interactions for Protein: Q6QEF8

CORO6, Coronin-6, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CORO6Q6QEF8 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC29.7■■■□□ 2.34
CORO6Q6QEF8 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CORO6Q6QEF8 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
CORO6Q6QEF8 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CORO6Q6QEF8 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CORO6Q6QEF8 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CORO6Q6QEF8 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CORO6Q6QEF8 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CORO6Q6QEF8 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CORO6Q6QEF8 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CORO6Q6QEF8 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CORO6Q6QEF8 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CORO6Q6QEF8 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CORO6Q6QEF8 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CORO6Q6QEF8 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CORO6Q6QEF8 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CORO6Q6QEF8 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CORO6Q6QEF8 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CORO6Q6QEF8 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CORO6Q6QEF8 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CORO6Q6QEF8 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CORO6Q6QEF8 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CORO6Q6QEF8 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CORO6Q6QEF8 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CORO6Q6QEF8 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CORO6Q6QEF8 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CORO6Q6QEF8 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CORO6Q6QEF8 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CORO6Q6QEF8 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CORO6Q6QEF8 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CORO6Q6QEF8 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CORO6Q6QEF8 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CORO6Q6QEF8 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CORO6Q6QEF8 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CORO6Q6QEF8 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CORO6Q6QEF8 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CORO6Q6QEF8 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CORO6Q6QEF8 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CORO6Q6QEF8 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CORO6Q6QEF8 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CORO6Q6QEF8 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CORO6Q6QEF8 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CORO6Q6QEF8 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CORO6Q6QEF8 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CORO6Q6QEF8 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CORO6Q6QEF8 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CORO6Q6QEF8 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CORO6Q6QEF8 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CORO6Q6QEF8 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CORO6Q6QEF8 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CORO6Q6QEF8 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CORO6Q6QEF8 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CORO6Q6QEF8 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CORO6Q6QEF8 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CORO6Q6QEF8 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CORO6Q6QEF8 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CORO6Q6QEF8 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CORO6Q6QEF8 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CORO6Q6QEF8 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CORO6Q6QEF8 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CORO6Q6QEF8 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CORO6Q6QEF8 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CORO6Q6QEF8 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CORO6Q6QEF8 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CORO6Q6QEF8 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CORO6Q6QEF8 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CORO6Q6QEF8 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CORO6Q6QEF8 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CORO6Q6QEF8 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CORO6Q6QEF8 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CORO6Q6QEF8 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CORO6Q6QEF8 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CORO6Q6QEF8 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CORO6Q6QEF8 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CORO6Q6QEF8 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CORO6Q6QEF8 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CORO6Q6QEF8 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CORO6Q6QEF8 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
CORO6Q6QEF8 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CORO6Q6QEF8 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CORO6Q6QEF8 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CORO6Q6QEF8 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CORO6Q6QEF8 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CORO6Q6QEF8 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CORO6Q6QEF8 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CORO6Q6QEF8 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CORO6Q6QEF8 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CORO6Q6QEF8 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CORO6Q6QEF8 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CORO6Q6QEF8 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
CORO6Q6QEF8 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CORO6Q6QEF8 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CORO6Q6QEF8 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CORO6Q6QEF8 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CORO6Q6QEF8 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CORO6Q6QEF8 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CORO6Q6QEF8 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CORO6Q6QEF8 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CORO6Q6QEF8 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CORO6Q6QEF8 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.9 ms