Protein–RNA interactions for Protein: Q587I9

SFT2D3, Vesicle transport protein SFT2C, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D3Q587I9 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SFT2D3Q587I9 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SFT2D3Q587I9 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SFT2D3Q587I9 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SFT2D3Q587I9 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SFT2D3Q587I9 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SFT2D3Q587I9 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SFT2D3Q587I9 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
SFT2D3Q587I9 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SFT2D3Q587I9 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SFT2D3Q587I9 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SFT2D3Q587I9 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
SFT2D3Q587I9 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SFT2D3Q587I9 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SFT2D3Q587I9 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SFT2D3Q587I9 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SFT2D3Q587I9 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SFT2D3Q587I9 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SFT2D3Q587I9 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SFT2D3Q587I9 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SFT2D3Q587I9 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SFT2D3Q587I9 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SFT2D3Q587I9 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SFT2D3Q587I9 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SFT2D3Q587I9 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SFT2D3Q587I9 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SFT2D3Q587I9 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SFT2D3Q587I9 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
SFT2D3Q587I9 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SFT2D3Q587I9 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SFT2D3Q587I9 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SFT2D3Q587I9 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SFT2D3Q587I9 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SFT2D3Q587I9 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SFT2D3Q587I9 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SFT2D3Q587I9 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SFT2D3Q587I9 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SFT2D3Q587I9 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SFT2D3Q587I9 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SFT2D3Q587I9 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SFT2D3Q587I9 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SFT2D3Q587I9 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SFT2D3Q587I9 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SFT2D3Q587I9 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SFT2D3Q587I9 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SFT2D3Q587I9 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SFT2D3Q587I9 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SFT2D3Q587I9 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SFT2D3Q587I9 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SFT2D3Q587I9 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SFT2D3Q587I9 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SFT2D3Q587I9 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SFT2D3Q587I9 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SFT2D3Q587I9 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SFT2D3Q587I9 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SFT2D3Q587I9 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SFT2D3Q587I9 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SFT2D3Q587I9 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SFT2D3Q587I9 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SFT2D3Q587I9 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
SFT2D3Q587I9 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SFT2D3Q587I9 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SFT2D3Q587I9 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
SFT2D3Q587I9 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SFT2D3Q587I9 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SFT2D3Q587I9 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SFT2D3Q587I9 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SFT2D3Q587I9 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SFT2D3Q587I9 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SFT2D3Q587I9 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SFT2D3Q587I9 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SFT2D3Q587I9 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SFT2D3Q587I9 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SFT2D3Q587I9 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SFT2D3Q587I9 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SFT2D3Q587I9 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SFT2D3Q587I9 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SFT2D3Q587I9 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SFT2D3Q587I9 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SFT2D3Q587I9 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SFT2D3Q587I9 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SFT2D3Q587I9 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
SFT2D3Q587I9 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SFT2D3Q587I9 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SFT2D3Q587I9 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SFT2D3Q587I9 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SFT2D3Q587I9 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SFT2D3Q587I9 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SFT2D3Q587I9 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SFT2D3Q587I9 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SFT2D3Q587I9 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SFT2D3Q587I9 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SFT2D3Q587I9 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SFT2D3Q587I9 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SFT2D3Q587I9 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SFT2D3Q587I9 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SFT2D3Q587I9 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SFT2D3Q587I9 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SFT2D3Q587I9 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SFT2D3Q587I9 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms