Protein–RNA interactions for Protein: Q49AG3

ZBED5, Zinc finger BED domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED5Q49AG3 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ZBED5Q49AG3 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ZBED5Q49AG3 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ZBED5Q49AG3 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ZBED5Q49AG3 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ZBED5Q49AG3 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ZBED5Q49AG3 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZBED5Q49AG3 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZBED5Q49AG3 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ZBED5Q49AG3 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ZBED5Q49AG3 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ZBED5Q49AG3 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ZBED5Q49AG3 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZBED5Q49AG3 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
ZBED5Q49AG3 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
ZBED5Q49AG3 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ZBED5Q49AG3 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ZBED5Q49AG3 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ZBED5Q49AG3 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ZBED5Q49AG3 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZBED5Q49AG3 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
ZBED5Q49AG3 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ZBED5Q49AG3 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ZBED5Q49AG3 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ZBED5Q49AG3 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ZBED5Q49AG3 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZBED5Q49AG3 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZBED5Q49AG3 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZBED5Q49AG3 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZBED5Q49AG3 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZBED5Q49AG3 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
ZBED5Q49AG3 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZBED5Q49AG3 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZBED5Q49AG3 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZBED5Q49AG3 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZBED5Q49AG3 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZBED5Q49AG3 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZBED5Q49AG3 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZBED5Q49AG3 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZBED5Q49AG3 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ZBED5Q49AG3 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZBED5Q49AG3 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZBED5Q49AG3 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZBED5Q49AG3 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ZBED5Q49AG3 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ZBED5Q49AG3 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ZBED5Q49AG3 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZBED5Q49AG3 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZBED5Q49AG3 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZBED5Q49AG3 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZBED5Q49AG3 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZBED5Q49AG3 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZBED5Q49AG3 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZBED5Q49AG3 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZBED5Q49AG3 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZBED5Q49AG3 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZBED5Q49AG3 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZBED5Q49AG3 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ZBED5Q49AG3 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZBED5Q49AG3 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZBED5Q49AG3 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
ZBED5Q49AG3 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZBED5Q49AG3 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZBED5Q49AG3 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ZBED5Q49AG3 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ZBED5Q49AG3 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ZBED5Q49AG3 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ZBED5Q49AG3 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZBED5Q49AG3 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZBED5Q49AG3 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZBED5Q49AG3 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZBED5Q49AG3 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZBED5Q49AG3 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZBED5Q49AG3 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZBED5Q49AG3 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZBED5Q49AG3 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZBED5Q49AG3 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZBED5Q49AG3 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZBED5Q49AG3 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZBED5Q49AG3 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZBED5Q49AG3 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZBED5Q49AG3 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZBED5Q49AG3 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZBED5Q49AG3 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZBED5Q49AG3 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZBED5Q49AG3 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZBED5Q49AG3 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZBED5Q49AG3 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZBED5Q49AG3 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZBED5Q49AG3 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZBED5Q49AG3 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZBED5Q49AG3 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZBED5Q49AG3 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZBED5Q49AG3 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZBED5Q49AG3 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZBED5Q49AG3 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZBED5Q49AG3 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZBED5Q49AG3 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
ZBED5Q49AG3 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZBED5Q49AG3 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92 ms