Protein–RNA interactions for Protein: Q15904

ATP6AP1, V-type proton ATPase subunit S1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1Q15904 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ATP6AP1Q15904 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ATP6AP1Q15904 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ATP6AP1Q15904 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ATP6AP1Q15904 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ATP6AP1Q15904 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ATP6AP1Q15904 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ATP6AP1Q15904 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
ATP6AP1Q15904 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ATP6AP1Q15904 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATP6AP1Q15904 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATP6AP1Q15904 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ATP6AP1Q15904 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ATP6AP1Q15904 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ATP6AP1Q15904 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ATP6AP1Q15904 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ATP6AP1Q15904 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ATP6AP1Q15904 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ATP6AP1Q15904 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ATP6AP1Q15904 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ATP6AP1Q15904 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ATP6AP1Q15904 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ATP6AP1Q15904 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ATP6AP1Q15904 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ATP6AP1Q15904 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ATP6AP1Q15904 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ATP6AP1Q15904 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
ATP6AP1Q15904 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ATP6AP1Q15904 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ATP6AP1Q15904 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ATP6AP1Q15904 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ATP6AP1Q15904 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ATP6AP1Q15904 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ATP6AP1Q15904 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ATP6AP1Q15904 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
ATP6AP1Q15904 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ATP6AP1Q15904 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ATP6AP1Q15904 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ATP6AP1Q15904 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ATP6AP1Q15904 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ATP6AP1Q15904 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ATP6AP1Q15904 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ATP6AP1Q15904 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ATP6AP1Q15904 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ATP6AP1Q15904 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ATP6AP1Q15904 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATP6AP1Q15904 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATP6AP1Q15904 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATP6AP1Q15904 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
ATP6AP1Q15904 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ATP6AP1Q15904 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ATP6AP1Q15904 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATP6AP1Q15904 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATP6AP1Q15904 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATP6AP1Q15904 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATP6AP1Q15904 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATP6AP1Q15904 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATP6AP1Q15904 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ATP6AP1Q15904 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATP6AP1Q15904 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATP6AP1Q15904 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATP6AP1Q15904 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATP6AP1Q15904 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATP6AP1Q15904 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATP6AP1Q15904 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATP6AP1Q15904 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ATP6AP1Q15904 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
ATP6AP1Q15904 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ATP6AP1Q15904 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
ATP6AP1Q15904 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATP6AP1Q15904 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATP6AP1Q15904 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ATP6AP1Q15904 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATP6AP1Q15904 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATP6AP1Q15904 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATP6AP1Q15904 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATP6AP1Q15904 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATP6AP1Q15904 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATP6AP1Q15904 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ATP6AP1Q15904 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ATP6AP1Q15904 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ATP6AP1Q15904 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ATP6AP1Q15904 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATP6AP1Q15904 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
ATP6AP1Q15904 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATP6AP1Q15904 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATP6AP1Q15904 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATP6AP1Q15904 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATP6AP1Q15904 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATP6AP1Q15904 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATP6AP1Q15904 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ATP6AP1Q15904 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ATP6AP1Q15904 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATP6AP1Q15904 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ATP6AP1Q15904 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATP6AP1Q15904 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATP6AP1Q15904 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATP6AP1Q15904 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATP6AP1Q15904 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATP6AP1Q15904 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
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