Protein–RNA interactions for Protein: Q15628

TRADD, Tumor necrosis factor receptor type 1-associated DEATH domain protein, humanhuman

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Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRADDQ15628 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TRADDQ15628 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TRADDQ15628 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
TRADDQ15628 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TRADDQ15628 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TRADDQ15628 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TRADDQ15628 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TRADDQ15628 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TRADDQ15628 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
TRADDQ15628 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TRADDQ15628 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TRADDQ15628 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TRADDQ15628 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
TRADDQ15628 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TRADDQ15628 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
TRADDQ15628 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TRADDQ15628 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
TRADDQ15628 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
TRADDQ15628 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TRADDQ15628 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TRADDQ15628 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TRADDQ15628 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TRADDQ15628 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TRADDQ15628 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TRADDQ15628 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TRADDQ15628 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TRADDQ15628 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TRADDQ15628 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TRADDQ15628 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TRADDQ15628 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TRADDQ15628 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TRADDQ15628 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TRADDQ15628 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TRADDQ15628 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TRADDQ15628 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
TRADDQ15628 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
TRADDQ15628 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TRADDQ15628 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TRADDQ15628 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TRADDQ15628 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TRADDQ15628 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TRADDQ15628 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
TRADDQ15628 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
TRADDQ15628 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TRADDQ15628 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TRADDQ15628 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TRADDQ15628 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TRADDQ15628 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TRADDQ15628 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TRADDQ15628 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
TRADDQ15628 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
TRADDQ15628 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
TRADDQ15628 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
TRADDQ15628 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TRADDQ15628 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TRADDQ15628 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TRADDQ15628 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TRADDQ15628 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.16
TRADDQ15628 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TRADDQ15628 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TRADDQ15628 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TRADDQ15628 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TRADDQ15628 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TRADDQ15628 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TRADDQ15628 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TRADDQ15628 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TRADDQ15628 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
TRADDQ15628 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TRADDQ15628 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
TRADDQ15628 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TRADDQ15628 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TRADDQ15628 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TRADDQ15628 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TRADDQ15628 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TRADDQ15628 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TRADDQ15628 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
TRADDQ15628 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TRADDQ15628 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TRADDQ15628 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TRADDQ15628 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TRADDQ15628 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TRADDQ15628 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TRADDQ15628 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TRADDQ15628 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TRADDQ15628 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TRADDQ15628 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TRADDQ15628 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TRADDQ15628 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TRADDQ15628 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TRADDQ15628 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TRADDQ15628 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TRADDQ15628 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TRADDQ15628 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TRADDQ15628 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TRADDQ15628 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
TRADDQ15628 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TRADDQ15628 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TRADDQ15628 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TRADDQ15628 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TRADDQ15628 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
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