Protein–RNA interactions for Protein: Q14761

PTPRCAP, Protein tyrosine phosphatase receptor type C-associated protein, humanhuman

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Length 206 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCAPQ14761 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PTPRCAPQ14761 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PTPRCAPQ14761 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PTPRCAPQ14761 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PTPRCAPQ14761 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PTPRCAPQ14761 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PTPRCAPQ14761 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PTPRCAPQ14761 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PTPRCAPQ14761 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PTPRCAPQ14761 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PTPRCAPQ14761 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PTPRCAPQ14761 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PTPRCAPQ14761 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PTPRCAPQ14761 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PTPRCAPQ14761 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PTPRCAPQ14761 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PTPRCAPQ14761 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PTPRCAPQ14761 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PTPRCAPQ14761 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PTPRCAPQ14761 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PTPRCAPQ14761 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PTPRCAPQ14761 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PTPRCAPQ14761 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PTPRCAPQ14761 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PTPRCAPQ14761 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PTPRCAPQ14761 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PTPRCAPQ14761 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PTPRCAPQ14761 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PTPRCAPQ14761 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PTPRCAPQ14761 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PTPRCAPQ14761 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PTPRCAPQ14761 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PTPRCAPQ14761 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PTPRCAPQ14761 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PTPRCAPQ14761 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PTPRCAPQ14761 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PTPRCAPQ14761 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PTPRCAPQ14761 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PTPRCAPQ14761 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PTPRCAPQ14761 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PTPRCAPQ14761 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PTPRCAPQ14761 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PTPRCAPQ14761 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PTPRCAPQ14761 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PTPRCAPQ14761 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PTPRCAPQ14761 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PTPRCAPQ14761 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PTPRCAPQ14761 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PTPRCAPQ14761 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PTPRCAPQ14761 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PTPRCAPQ14761 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PTPRCAPQ14761 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PTPRCAPQ14761 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
PTPRCAPQ14761 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PTPRCAPQ14761 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PTPRCAPQ14761 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PTPRCAPQ14761 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
PTPRCAPQ14761 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PTPRCAPQ14761 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
PTPRCAPQ14761 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.54■■■□□ 2
PTPRCAPQ14761 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
PTPRCAPQ14761 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
PTPRCAPQ14761 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
PTPRCAPQ14761 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
PTPRCAPQ14761 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PTPRCAPQ14761 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PTPRCAPQ14761 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PTPRCAPQ14761 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PTPRCAPQ14761 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PTPRCAPQ14761 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PTPRCAPQ14761 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PTPRCAPQ14761 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PTPRCAPQ14761 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
PTPRCAPQ14761 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PTPRCAPQ14761 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PTPRCAPQ14761 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PTPRCAPQ14761 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PTPRCAPQ14761 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PTPRCAPQ14761 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PTPRCAPQ14761 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PTPRCAPQ14761 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PTPRCAPQ14761 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
PTPRCAPQ14761 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PTPRCAPQ14761 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.97
PTPRCAPQ14761 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PTPRCAPQ14761 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PTPRCAPQ14761 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PTPRCAPQ14761 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PTPRCAPQ14761 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PTPRCAPQ14761 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PTPRCAPQ14761 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
PTPRCAPQ14761 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PTPRCAPQ14761 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PTPRCAPQ14761 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PTPRCAPQ14761 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PTPRCAPQ14761 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
PTPRCAPQ14761 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PTPRCAPQ14761 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PTPRCAPQ14761 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PTPRCAPQ14761 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
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