Protein–RNA interactions for Protein: Q14761

PTPRCAP, Protein tyrosine phosphatase receptor type C-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCAPQ14761 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC34.15■■■■□ 3.06
PTPRCAPQ14761 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
PTPRCAPQ14761 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
PTPRCAPQ14761 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
PTPRCAPQ14761 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
PTPRCAPQ14761 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
PTPRCAPQ14761 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
PTPRCAPQ14761 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
PTPRCAPQ14761 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
PTPRCAPQ14761 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC32.52■■■□□ 2.8
PTPRCAPQ14761 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
PTPRCAPQ14761 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
PTPRCAPQ14761 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
PTPRCAPQ14761 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.9■■■□□ 2.7
PTPRCAPQ14761 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.88■■■□□ 2.69
PTPRCAPQ14761 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC31.78■■■□□ 2.68
PTPRCAPQ14761 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
PTPRCAPQ14761 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
PTPRCAPQ14761 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.61
PTPRCAPQ14761 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
PTPRCAPQ14761 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC31.35■■■□□ 2.61
PTPRCAPQ14761 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.33■■■□□ 2.61
PTPRCAPQ14761 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
PTPRCAPQ14761 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC31.16■■■□□ 2.58
PTPRCAPQ14761 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
PTPRCAPQ14761 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
PTPRCAPQ14761 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
PTPRCAPQ14761 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC31.05■■■□□ 2.56
PTPRCAPQ14761 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
PTPRCAPQ14761 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
PTPRCAPQ14761 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
PTPRCAPQ14761 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
PTPRCAPQ14761 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
PTPRCAPQ14761 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
PTPRCAPQ14761 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
PTPRCAPQ14761 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC30.53■■■□□ 2.48
PTPRCAPQ14761 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
PTPRCAPQ14761 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
PTPRCAPQ14761 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
PTPRCAPQ14761 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
PTPRCAPQ14761 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
PTPRCAPQ14761 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
PTPRCAPQ14761 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC30.35■■■□□ 2.45
PTPRCAPQ14761 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
PTPRCAPQ14761 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
PTPRCAPQ14761 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
PTPRCAPQ14761 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
PTPRCAPQ14761 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
PTPRCAPQ14761 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC30.2■■■□□ 2.43
PTPRCAPQ14761 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.42
PTPRCAPQ14761 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
PTPRCAPQ14761 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
PTPRCAPQ14761 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
PTPRCAPQ14761 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
PTPRCAPQ14761 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
PTPRCAPQ14761 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
PTPRCAPQ14761 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
PTPRCAPQ14761 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
PTPRCAPQ14761 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
PTPRCAPQ14761 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
PTPRCAPQ14761 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
PTPRCAPQ14761 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
PTPRCAPQ14761 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
PTPRCAPQ14761 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
PTPRCAPQ14761 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
PTPRCAPQ14761 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
PTPRCAPQ14761 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
PTPRCAPQ14761 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PTPRCAPQ14761 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PTPRCAPQ14761 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PTPRCAPQ14761 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PTPRCAPQ14761 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
PTPRCAPQ14761 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PTPRCAPQ14761 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC29.47■■■□□ 2.31
PTPRCAPQ14761 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
PTPRCAPQ14761 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
PTPRCAPQ14761 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
PTPRCAPQ14761 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PTPRCAPQ14761 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PTPRCAPQ14761 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PTPRCAPQ14761 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PTPRCAPQ14761 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PTPRCAPQ14761 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PTPRCAPQ14761 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PTPRCAPQ14761 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PTPRCAPQ14761 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
PTPRCAPQ14761 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PTPRCAPQ14761 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PTPRCAPQ14761 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PTPRCAPQ14761 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PTPRCAPQ14761 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PTPRCAPQ14761 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PTPRCAPQ14761 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
PTPRCAPQ14761 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
PTPRCAPQ14761 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PTPRCAPQ14761 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PTPRCAPQ14761 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PTPRCAPQ14761 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.23
PTPRCAPQ14761 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PTPRCAPQ14761 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
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