Protein–RNA interactions for Protein: Q13885

TUBB2A, Tubulin beta-2A chain, humanhuman

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Length 445 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB2AQ13885 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
TUBB2AQ13885 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
TUBB2AQ13885 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
TUBB2AQ13885 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
TUBB2AQ13885 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
TUBB2AQ13885 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
TUBB2AQ13885 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
TUBB2AQ13885 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
TUBB2AQ13885 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
TUBB2AQ13885 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
TUBB2AQ13885 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
TUBB2AQ13885 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC29.64■■■□□ 2.34
TUBB2AQ13885 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
TUBB2AQ13885 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
TUBB2AQ13885 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
TUBB2AQ13885 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
TUBB2AQ13885 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
TUBB2AQ13885 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
TUBB2AQ13885 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
TUBB2AQ13885 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
TUBB2AQ13885 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
TUBB2AQ13885 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
TUBB2AQ13885 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
TUBB2AQ13885 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
TUBB2AQ13885 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
TUBB2AQ13885 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
TUBB2AQ13885 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
TUBB2AQ13885 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
TUBB2AQ13885 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
TUBB2AQ13885 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
TUBB2AQ13885 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
TUBB2AQ13885 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
TUBB2AQ13885 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
TUBB2AQ13885 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
TUBB2AQ13885 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
TUBB2AQ13885 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
TUBB2AQ13885 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
TUBB2AQ13885 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
TUBB2AQ13885 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
TUBB2AQ13885 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
TUBB2AQ13885 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
TUBB2AQ13885 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
TUBB2AQ13885 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
TUBB2AQ13885 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
TUBB2AQ13885 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
TUBB2AQ13885 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
TUBB2AQ13885 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
TUBB2AQ13885 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
TUBB2AQ13885 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
TUBB2AQ13885 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
TUBB2AQ13885 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TUBB2AQ13885 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TUBB2AQ13885 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
TUBB2AQ13885 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
TUBB2AQ13885 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TUBB2AQ13885 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
TUBB2AQ13885 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
TUBB2AQ13885 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TUBB2AQ13885 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
TUBB2AQ13885 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
TUBB2AQ13885 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
TUBB2AQ13885 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
TUBB2AQ13885 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TUBB2AQ13885 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
TUBB2AQ13885 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
TUBB2AQ13885 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
TUBB2AQ13885 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TUBB2AQ13885 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
TUBB2AQ13885 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
TUBB2AQ13885 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TUBB2AQ13885 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
TUBB2AQ13885 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TUBB2AQ13885 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TUBB2AQ13885 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
TUBB2AQ13885 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TUBB2AQ13885 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TUBB2AQ13885 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
TUBB2AQ13885 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
TUBB2AQ13885 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TUBB2AQ13885 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TUBB2AQ13885 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
TUBB2AQ13885 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC29.12■■■□□ 2.25
TUBB2AQ13885 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TUBB2AQ13885 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TUBB2AQ13885 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TUBB2AQ13885 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
TUBB2AQ13885 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
TUBB2AQ13885 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
TUBB2AQ13885 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TUBB2AQ13885 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TUBB2AQ13885 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
TUBB2AQ13885 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TUBB2AQ13885 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TUBB2AQ13885 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TUBB2AQ13885 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TUBB2AQ13885 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
TUBB2AQ13885 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TUBB2AQ13885 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TUBB2AQ13885 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TUBB2AQ13885 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
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