Protein–RNA interactions for Protein: Q13885

TUBB2A, Tubulin beta-2A chain, humanhuman

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Length 445 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB2AQ13885 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC35.88■■■■□ 3.33
TUBB2AQ13885 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC35.75■■■■□ 3.31
TUBB2AQ13885 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
TUBB2AQ13885 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
TUBB2AQ13885 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC34.88■■■■□ 3.17
TUBB2AQ13885 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
TUBB2AQ13885 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC34.66■■■■□ 3.14
TUBB2AQ13885 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
TUBB2AQ13885 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
TUBB2AQ13885 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC34.38■■■■□ 3.09
TUBB2AQ13885 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC34.33■■■■□ 3.09
TUBB2AQ13885 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
TUBB2AQ13885 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC34.3■■■■□ 3.08
TUBB2AQ13885 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
TUBB2AQ13885 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
TUBB2AQ13885 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
TUBB2AQ13885 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
TUBB2AQ13885 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
TUBB2AQ13885 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
TUBB2AQ13885 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
TUBB2AQ13885 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
TUBB2AQ13885 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
TUBB2AQ13885 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
TUBB2AQ13885 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
TUBB2AQ13885 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.87
TUBB2AQ13885 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
TUBB2AQ13885 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
TUBB2AQ13885 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
TUBB2AQ13885 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
TUBB2AQ13885 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
TUBB2AQ13885 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
TUBB2AQ13885 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
TUBB2AQ13885 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
TUBB2AQ13885 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
TUBB2AQ13885 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
TUBB2AQ13885 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
TUBB2AQ13885 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
TUBB2AQ13885 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
TUBB2AQ13885 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
TUBB2AQ13885 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
TUBB2AQ13885 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC32.22■■■□□ 2.75
TUBB2AQ13885 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
TUBB2AQ13885 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC32.08■■■□□ 2.73
TUBB2AQ13885 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
TUBB2AQ13885 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
TUBB2AQ13885 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
TUBB2AQ13885 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.91■■■□□ 2.7
TUBB2AQ13885 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
TUBB2AQ13885 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
TUBB2AQ13885 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
TUBB2AQ13885 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
TUBB2AQ13885 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
TUBB2AQ13885 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC31.73■■■□□ 2.67
TUBB2AQ13885 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC31.71■■■□□ 2.67
TUBB2AQ13885 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
TUBB2AQ13885 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.67
TUBB2AQ13885 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
TUBB2AQ13885 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
TUBB2AQ13885 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
TUBB2AQ13885 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
TUBB2AQ13885 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
TUBB2AQ13885 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
TUBB2AQ13885 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.51■■■□□ 2.63
TUBB2AQ13885 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
TUBB2AQ13885 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
TUBB2AQ13885 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
TUBB2AQ13885 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
TUBB2AQ13885 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.37■■■□□ 2.61
TUBB2AQ13885 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
TUBB2AQ13885 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
TUBB2AQ13885 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.3■■■□□ 2.6
TUBB2AQ13885 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.3■■■□□ 2.6
TUBB2AQ13885 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.59
TUBB2AQ13885 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
TUBB2AQ13885 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
TUBB2AQ13885 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
TUBB2AQ13885 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
TUBB2AQ13885 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
TUBB2AQ13885 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
TUBB2AQ13885 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
TUBB2AQ13885 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
TUBB2AQ13885 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
TUBB2AQ13885 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
TUBB2AQ13885 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.58
TUBB2AQ13885 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
TUBB2AQ13885 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
TUBB2AQ13885 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
TUBB2AQ13885 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
TUBB2AQ13885 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
TUBB2AQ13885 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
TUBB2AQ13885 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.56
TUBB2AQ13885 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
TUBB2AQ13885 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
TUBB2AQ13885 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
TUBB2AQ13885 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
TUBB2AQ13885 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
TUBB2AQ13885 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.54
TUBB2AQ13885 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
TUBB2AQ13885 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
TUBB2AQ13885 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
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