Protein–RNA interactions for Protein: Q08493

PDE4C, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4C, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4CQ08493 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
PDE4CQ08493 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
PDE4CQ08493 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
PDE4CQ08493 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PDE4CQ08493 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PDE4CQ08493 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
PDE4CQ08493 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
PDE4CQ08493 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
PDE4CQ08493 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
PDE4CQ08493 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC29.84■■■□□ 2.37
PDE4CQ08493 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PDE4CQ08493 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
PDE4CQ08493 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
PDE4CQ08493 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
PDE4CQ08493 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
PDE4CQ08493 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
PDE4CQ08493 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
PDE4CQ08493 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PDE4CQ08493 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
PDE4CQ08493 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
PDE4CQ08493 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
PDE4CQ08493 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC29.77■■■□□ 2.36
PDE4CQ08493 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
PDE4CQ08493 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
PDE4CQ08493 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
PDE4CQ08493 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
PDE4CQ08493 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
PDE4CQ08493 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
PDE4CQ08493 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
PDE4CQ08493 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
PDE4CQ08493 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
PDE4CQ08493 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
PDE4CQ08493 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
PDE4CQ08493 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
PDE4CQ08493 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
PDE4CQ08493 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC29.69■■■□□ 2.34
PDE4CQ08493 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
PDE4CQ08493 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
PDE4CQ08493 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
PDE4CQ08493 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
PDE4CQ08493 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
PDE4CQ08493 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
PDE4CQ08493 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PDE4CQ08493 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
PDE4CQ08493 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
PDE4CQ08493 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
PDE4CQ08493 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
PDE4CQ08493 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC29.59■■■□□ 2.33
PDE4CQ08493 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
PDE4CQ08493 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
PDE4CQ08493 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PDE4CQ08493 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
PDE4CQ08493 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PDE4CQ08493 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PDE4CQ08493 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
PDE4CQ08493 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PDE4CQ08493 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
PDE4CQ08493 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
PDE4CQ08493 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
PDE4CQ08493 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
PDE4CQ08493 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
PDE4CQ08493 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PDE4CQ08493 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PDE4CQ08493 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PDE4CQ08493 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PDE4CQ08493 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PDE4CQ08493 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
PDE4CQ08493 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
PDE4CQ08493 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
PDE4CQ08493 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
PDE4CQ08493 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
PDE4CQ08493 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PDE4CQ08493 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
PDE4CQ08493 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PDE4CQ08493 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PDE4CQ08493 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
PDE4CQ08493 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PDE4CQ08493 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
PDE4CQ08493 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.29
PDE4CQ08493 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PDE4CQ08493 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PDE4CQ08493 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PDE4CQ08493 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PDE4CQ08493 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PDE4CQ08493 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PDE4CQ08493 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PDE4CQ08493 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PDE4CQ08493 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PDE4CQ08493 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PDE4CQ08493 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PDE4CQ08493 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PDE4CQ08493 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PDE4CQ08493 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PDE4CQ08493 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PDE4CQ08493 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PDE4CQ08493 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PDE4CQ08493 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PDE4CQ08493 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
PDE4CQ08493 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PDE4CQ08493 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms