Protein–RNA interactions for Protein: Q08493

PDE4C, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4C, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4CQ08493 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
PDE4CQ08493 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC36.22■■■■□ 3.39
PDE4CQ08493 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
PDE4CQ08493 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC35.23■■■■□ 3.23
PDE4CQ08493 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.21■■■■□ 3.23
PDE4CQ08493 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
PDE4CQ08493 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
PDE4CQ08493 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
PDE4CQ08493 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC34.75■■■■□ 3.15
PDE4CQ08493 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC34.65■■■■□ 3.14
PDE4CQ08493 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
PDE4CQ08493 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
PDE4CQ08493 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
PDE4CQ08493 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
PDE4CQ08493 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.07■■■■□ 3.04
PDE4CQ08493 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
PDE4CQ08493 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
PDE4CQ08493 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC33.71■■■□□ 2.99
PDE4CQ08493 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.96
PDE4CQ08493 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
PDE4CQ08493 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC33.45■■■□□ 2.95
PDE4CQ08493 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
PDE4CQ08493 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC33.37■■■□□ 2.93
PDE4CQ08493 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
PDE4CQ08493 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
PDE4CQ08493 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC33.15■■■□□ 2.9
PDE4CQ08493 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
PDE4CQ08493 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
PDE4CQ08493 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
PDE4CQ08493 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
PDE4CQ08493 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
PDE4CQ08493 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC32.66■■■□□ 2.82
PDE4CQ08493 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
PDE4CQ08493 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
PDE4CQ08493 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
PDE4CQ08493 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
PDE4CQ08493 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
PDE4CQ08493 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
PDE4CQ08493 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
PDE4CQ08493 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
PDE4CQ08493 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
PDE4CQ08493 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
PDE4CQ08493 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
PDE4CQ08493 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
PDE4CQ08493 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
PDE4CQ08493 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
PDE4CQ08493 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
PDE4CQ08493 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
PDE4CQ08493 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC32.2■■■□□ 2.75
PDE4CQ08493 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
PDE4CQ08493 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC32.16■■■□□ 2.74
PDE4CQ08493 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
PDE4CQ08493 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
PDE4CQ08493 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
PDE4CQ08493 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
PDE4CQ08493 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
PDE4CQ08493 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.95■■■□□ 2.71
PDE4CQ08493 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
PDE4CQ08493 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.82■■■□□ 2.68
PDE4CQ08493 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
PDE4CQ08493 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC31.79■■■□□ 2.68
PDE4CQ08493 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC31.78■■■□□ 2.68
PDE4CQ08493 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
PDE4CQ08493 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
PDE4CQ08493 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
PDE4CQ08493 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
PDE4CQ08493 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
PDE4CQ08493 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
PDE4CQ08493 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
PDE4CQ08493 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC31.55■■■□□ 2.64
PDE4CQ08493 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
PDE4CQ08493 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
PDE4CQ08493 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
PDE4CQ08493 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
PDE4CQ08493 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC31.43■■■□□ 2.62
PDE4CQ08493 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
PDE4CQ08493 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC31.42■■■□□ 2.62
PDE4CQ08493 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
PDE4CQ08493 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.61
PDE4CQ08493 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC31.32■■■□□ 2.6
PDE4CQ08493 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
PDE4CQ08493 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
PDE4CQ08493 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
PDE4CQ08493 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC31.26■■■□□ 2.59
PDE4CQ08493 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
PDE4CQ08493 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
PDE4CQ08493 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC31.24■■■□□ 2.59
PDE4CQ08493 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
PDE4CQ08493 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
PDE4CQ08493 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
PDE4CQ08493 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
PDE4CQ08493 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
PDE4CQ08493 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
PDE4CQ08493 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC31.12■■■□□ 2.57
PDE4CQ08493 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
PDE4CQ08493 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC31.1■■■□□ 2.57
PDE4CQ08493 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
PDE4CQ08493 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
PDE4CQ08493 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
PDE4CQ08493 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 217.3 ms