Protein–RNA interactions for Protein: P78412

IRX6, Iroquois-class homeodomain protein IRX-6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX6P78412 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
IRX6P78412 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
IRX6P78412 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
IRX6P78412 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
IRX6P78412 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
IRX6P78412 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
IRX6P78412 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
IRX6P78412 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
IRX6P78412 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
IRX6P78412 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC36.27■■■■□ 3.4
IRX6P78412 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
IRX6P78412 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
IRX6P78412 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.24■■■■□ 3.39
IRX6P78412 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
IRX6P78412 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
IRX6P78412 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC36.23■■■■□ 3.39
IRX6P78412 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
IRX6P78412 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC36.18■■■■□ 3.38
IRX6P78412 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC36.17■■■■□ 3.38
IRX6P78412 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
IRX6P78412 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
IRX6P78412 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
IRX6P78412 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC36.1■■■■□ 3.37
IRX6P78412 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
IRX6P78412 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
IRX6P78412 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
IRX6P78412 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
IRX6P78412 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
IRX6P78412 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC36.04■■■■□ 3.36
IRX6P78412 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC36.04■■■■□ 3.36
IRX6P78412 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
IRX6P78412 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
IRX6P78412 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC36■■■■□ 3.35
IRX6P78412 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
IRX6P78412 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
IRX6P78412 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC35.97■■■■□ 3.35
IRX6P78412 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
IRX6P78412 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC35.97■■■■□ 3.35
IRX6P78412 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC35.96■■■■□ 3.35
IRX6P78412 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
IRX6P78412 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.93■■■■□ 3.34
IRX6P78412 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
IRX6P78412 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
IRX6P78412 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC35.91■■■■□ 3.34
IRX6P78412 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
IRX6P78412 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
IRX6P78412 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC35.89■■■■□ 3.34
IRX6P78412 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
IRX6P78412 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
IRX6P78412 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
IRX6P78412 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
IRX6P78412 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC35.87■■■■□ 3.33
IRX6P78412 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC35.86■■■■□ 3.33
IRX6P78412 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
IRX6P78412 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC35.85■■■■□ 3.33
IRX6P78412 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
IRX6P78412 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.81■■■■□ 3.32
IRX6P78412 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
IRX6P78412 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
IRX6P78412 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
IRX6P78412 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
IRX6P78412 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
IRX6P78412 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC35.77■■■■□ 3.32
IRX6P78412 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC35.77■■■■□ 3.32
IRX6P78412 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.76■■■■□ 3.32
IRX6P78412 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
IRX6P78412 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
IRX6P78412 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
IRX6P78412 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
IRX6P78412 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
IRX6P78412 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.7■■■■□ 3.31
IRX6P78412 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.69■■■■□ 3.3
IRX6P78412 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
IRX6P78412 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC35.68■■■■□ 3.3
IRX6P78412 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
IRX6P78412 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC35.64■■■■□ 3.3
IRX6P78412 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.64■■■■□ 3.3
IRX6P78412 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC35.64■■■■□ 3.3
IRX6P78412 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
IRX6P78412 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.57■■■■□ 3.29
IRX6P78412 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.29
IRX6P78412 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
IRX6P78412 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
IRX6P78412 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
IRX6P78412 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC35.55■■■■□ 3.28
IRX6P78412 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC35.53■■■■□ 3.28
IRX6P78412 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
IRX6P78412 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.53■■■■□ 3.28
IRX6P78412 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
IRX6P78412 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
IRX6P78412 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
IRX6P78412 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.48■■■■□ 3.27
IRX6P78412 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC35.47■■■■□ 3.27
IRX6P78412 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
IRX6P78412 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC35.47■■■■□ 3.27
IRX6P78412 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.47■■■■□ 3.27
IRX6P78412 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.46■■■■□ 3.27
IRX6P78412 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
IRX6P78412 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC35.46■■■■□ 3.27
IRX6P78412 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC35.46■■■■□ 3.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms