Protein–RNA interactions for Protein: P68400

CSNK2A1, Casein kinase II subunit alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A1P68400 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CSNK2A1P68400 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CSNK2A1P68400 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CSNK2A1P68400 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CSNK2A1P68400 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CSNK2A1P68400 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CSNK2A1P68400 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CSNK2A1P68400 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CSNK2A1P68400 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CSNK2A1P68400 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CSNK2A1P68400 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CSNK2A1P68400 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CSNK2A1P68400 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CSNK2A1P68400 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CSNK2A1P68400 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CSNK2A1P68400 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CSNK2A1P68400 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CSNK2A1P68400 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CSNK2A1P68400 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CSNK2A1P68400 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CSNK2A1P68400 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CSNK2A1P68400 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CSNK2A1P68400 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CSNK2A1P68400 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CSNK2A1P68400 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CSNK2A1P68400 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CSNK2A1P68400 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CSNK2A1P68400 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CSNK2A1P68400 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CSNK2A1P68400 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CSNK2A1P68400 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CSNK2A1P68400 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CSNK2A1P68400 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CSNK2A1P68400 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CSNK2A1P68400 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CSNK2A1P68400 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CSNK2A1P68400 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CSNK2A1P68400 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CSNK2A1P68400 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CSNK2A1P68400 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CSNK2A1P68400 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CSNK2A1P68400 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CSNK2A1P68400 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CSNK2A1P68400 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CSNK2A1P68400 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CSNK2A1P68400 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CSNK2A1P68400 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CSNK2A1P68400 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CSNK2A1P68400 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CSNK2A1P68400 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CSNK2A1P68400 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CSNK2A1P68400 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CSNK2A1P68400 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CSNK2A1P68400 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CSNK2A1P68400 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CSNK2A1P68400 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CSNK2A1P68400 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CSNK2A1P68400 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CSNK2A1P68400 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CSNK2A1P68400 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CSNK2A1P68400 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CSNK2A1P68400 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CSNK2A1P68400 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CSNK2A1P68400 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CSNK2A1P68400 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CSNK2A1P68400 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CSNK2A1P68400 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CSNK2A1P68400 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CSNK2A1P68400 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CSNK2A1P68400 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CSNK2A1P68400 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CSNK2A1P68400 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CSNK2A1P68400 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CSNK2A1P68400 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CSNK2A1P68400 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CSNK2A1P68400 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CSNK2A1P68400 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CSNK2A1P68400 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CSNK2A1P68400 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CSNK2A1P68400 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CSNK2A1P68400 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CSNK2A1P68400 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CSNK2A1P68400 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CSNK2A1P68400 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CSNK2A1P68400 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CSNK2A1P68400 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CSNK2A1P68400 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CSNK2A1P68400 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CSNK2A1P68400 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CSNK2A1P68400 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CSNK2A1P68400 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CSNK2A1P68400 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CSNK2A1P68400 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CSNK2A1P68400 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CSNK2A1P68400 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CSNK2A1P68400 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CSNK2A1P68400 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CSNK2A1P68400 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CSNK2A1P68400 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CSNK2A1P68400 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.1 ms