Protein–RNA interactions for Protein: P67809

YBX1, Nuclease-sensitive element-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YBX1P67809 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
YBX1P67809 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
YBX1P67809 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
YBX1P67809 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
YBX1P67809 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
YBX1P67809 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
YBX1P67809 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
YBX1P67809 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
YBX1P67809 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
YBX1P67809 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
YBX1P67809 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
YBX1P67809 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
YBX1P67809 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
YBX1P67809 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
YBX1P67809 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
YBX1P67809 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
YBX1P67809 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
YBX1P67809 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
YBX1P67809 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
YBX1P67809 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
YBX1P67809 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
YBX1P67809 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
YBX1P67809 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
YBX1P67809 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
YBX1P67809 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
YBX1P67809 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
YBX1P67809 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
YBX1P67809 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
YBX1P67809 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
YBX1P67809 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
YBX1P67809 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
YBX1P67809 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
YBX1P67809 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
YBX1P67809 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
YBX1P67809 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
YBX1P67809 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
YBX1P67809 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
YBX1P67809 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
YBX1P67809 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
YBX1P67809 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
YBX1P67809 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
YBX1P67809 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
YBX1P67809 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.89
YBX1P67809 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
YBX1P67809 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
YBX1P67809 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
YBX1P67809 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
YBX1P67809 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
YBX1P67809 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
YBX1P67809 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
YBX1P67809 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
YBX1P67809 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
YBX1P67809 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
YBX1P67809 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
YBX1P67809 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
YBX1P67809 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
YBX1P67809 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
YBX1P67809 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
YBX1P67809 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
YBX1P67809 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
YBX1P67809 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
YBX1P67809 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
YBX1P67809 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
YBX1P67809 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
YBX1P67809 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
YBX1P67809 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
YBX1P67809 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
YBX1P67809 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
YBX1P67809 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
YBX1P67809 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
YBX1P67809 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
YBX1P67809 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
YBX1P67809 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.87
YBX1P67809 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
YBX1P67809 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
YBX1P67809 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
YBX1P67809 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
YBX1P67809 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
YBX1P67809 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
YBX1P67809 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
YBX1P67809 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
YBX1P67809 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
YBX1P67809 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
YBX1P67809 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
YBX1P67809 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
YBX1P67809 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
YBX1P67809 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
YBX1P67809 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
YBX1P67809 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
YBX1P67809 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
YBX1P67809 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
YBX1P67809 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
YBX1P67809 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.59■■□□□ 1.85
YBX1P67809 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
YBX1P67809 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
YBX1P67809 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
YBX1P67809 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
YBX1P67809 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
YBX1P67809 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
YBX1P67809 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms