Protein–RNA interactions for Protein: P53007

SLC25A1, Tricarboxylate transport protein, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A1P53007 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC25A1P53007 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC25A1P53007 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC25A1P53007 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC25A1P53007 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC25A1P53007 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC25A1P53007 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC25A1P53007 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC25A1P53007 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC25A1P53007 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC25A1P53007 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC25A1P53007 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC25A1P53007 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC25A1P53007 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC25A1P53007 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC25A1P53007 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC25A1P53007 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC25A1P53007 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC25A1P53007 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC25A1P53007 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC25A1P53007 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC25A1P53007 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SLC25A1P53007 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC25A1P53007 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC25A1P53007 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC25A1P53007 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC25A1P53007 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC25A1P53007 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC25A1P53007 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC25A1P53007 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC25A1P53007 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC25A1P53007 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC25A1P53007 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC25A1P53007 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC25A1P53007 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC25A1P53007 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC25A1P53007 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC25A1P53007 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC25A1P53007 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SLC25A1P53007 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC25A1P53007 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC25A1P53007 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC25A1P53007 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC25A1P53007 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC25A1P53007 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC25A1P53007 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC25A1P53007 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC25A1P53007 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SLC25A1P53007 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC25A1P53007 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC25A1P53007 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC25A1P53007 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC25A1P53007 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC25A1P53007 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC25A1P53007 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC25A1P53007 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC25A1P53007 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC25A1P53007 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC25A1P53007 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC25A1P53007 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC25A1P53007 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC25A1P53007 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC25A1P53007 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC25A1P53007 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC25A1P53007 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC25A1P53007 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC25A1P53007 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC25A1P53007 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC25A1P53007 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC25A1P53007 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC25A1P53007 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC25A1P53007 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC25A1P53007 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC25A1P53007 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC25A1P53007 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC25A1P53007 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC25A1P53007 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC25A1P53007 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC25A1P53007 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC25A1P53007 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC25A1P53007 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC25A1P53007 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC25A1P53007 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC25A1P53007 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC25A1P53007 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC25A1P53007 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC25A1P53007 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC25A1P53007 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC25A1P53007 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC25A1P53007 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC25A1P53007 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC25A1P53007 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC25A1P53007 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC25A1P53007 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC25A1P53007 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC25A1P53007 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC25A1P53007 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC25A1P53007 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC25A1P53007 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
SLC25A1P53007 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms