Protein–RNA interactions for Protein: P48728

AMT, Aminomethyltransferase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMTP48728 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
AMTP48728 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
AMTP48728 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
AMTP48728 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
AMTP48728 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
AMTP48728 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
AMTP48728 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
AMTP48728 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
AMTP48728 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
AMTP48728 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
AMTP48728 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
AMTP48728 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
AMTP48728 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
AMTP48728 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
AMTP48728 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
AMTP48728 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
AMTP48728 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
AMTP48728 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
AMTP48728 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
AMTP48728 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
AMTP48728 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.91
AMTP48728 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
AMTP48728 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
AMTP48728 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
AMTP48728 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
AMTP48728 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
AMTP48728 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
AMTP48728 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
AMTP48728 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
AMTP48728 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
AMTP48728 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
AMTP48728 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
AMTP48728 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
AMTP48728 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
AMTP48728 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
AMTP48728 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
AMTP48728 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
AMTP48728 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
AMTP48728 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
AMTP48728 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
AMTP48728 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
AMTP48728 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
AMTP48728 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
AMTP48728 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
AMTP48728 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
AMTP48728 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
AMTP48728 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
AMTP48728 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
AMTP48728 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
AMTP48728 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
AMTP48728 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
AMTP48728 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
AMTP48728 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
AMTP48728 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
AMTP48728 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
AMTP48728 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
AMTP48728 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
AMTP48728 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
AMTP48728 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
AMTP48728 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
AMTP48728 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
AMTP48728 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
AMTP48728 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
AMTP48728 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
AMTP48728 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
AMTP48728 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
AMTP48728 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
AMTP48728 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
AMTP48728 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
AMTP48728 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
AMTP48728 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
AMTP48728 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
AMTP48728 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
AMTP48728 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
AMTP48728 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
AMTP48728 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
AMTP48728 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
AMTP48728 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
AMTP48728 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
AMTP48728 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
AMTP48728 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
AMTP48728 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
AMTP48728 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
AMTP48728 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
AMTP48728 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
AMTP48728 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
AMTP48728 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
AMTP48728 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
AMTP48728 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
AMTP48728 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
AMTP48728 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
AMTP48728 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
AMTP48728 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
AMTP48728 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
AMTP48728 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
AMTP48728 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
AMTP48728 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
AMTP48728 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
AMTP48728 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
AMTP48728 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.7 ms