Protein–RNA interactions for Protein: P43354

NR4A2, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 2, humanhuman

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR4A2P43354 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NR4A2P43354 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NR4A2P43354 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NR4A2P43354 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NR4A2P43354 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NR4A2P43354 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NR4A2P43354 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NR4A2P43354 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NR4A2P43354 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NR4A2P43354 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NR4A2P43354 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NR4A2P43354 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NR4A2P43354 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NR4A2P43354 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NR4A2P43354 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NR4A2P43354 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NR4A2P43354 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NR4A2P43354 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NR4A2P43354 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NR4A2P43354 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NR4A2P43354 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NR4A2P43354 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NR4A2P43354 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NR4A2P43354 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NR4A2P43354 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NR4A2P43354 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NR4A2P43354 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NR4A2P43354 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NR4A2P43354 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NR4A2P43354 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NR4A2P43354 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
NR4A2P43354 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NR4A2P43354 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NR4A2P43354 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NR4A2P43354 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NR4A2P43354 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NR4A2P43354 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NR4A2P43354 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NR4A2P43354 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NR4A2P43354 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NR4A2P43354 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NR4A2P43354 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NR4A2P43354 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NR4A2P43354 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NR4A2P43354 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NR4A2P43354 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NR4A2P43354 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NR4A2P43354 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NR4A2P43354 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NR4A2P43354 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NR4A2P43354 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NR4A2P43354 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NR4A2P43354 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NR4A2P43354 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NR4A2P43354 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NR4A2P43354 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NR4A2P43354 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NR4A2P43354 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NR4A2P43354 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NR4A2P43354 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NR4A2P43354 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NR4A2P43354 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
NR4A2P43354 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NR4A2P43354 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NR4A2P43354 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NR4A2P43354 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NR4A2P43354 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NR4A2P43354 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NR4A2P43354 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NR4A2P43354 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NR4A2P43354 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NR4A2P43354 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NR4A2P43354 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NR4A2P43354 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NR4A2P43354 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NR4A2P43354 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
NR4A2P43354 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NR4A2P43354 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NR4A2P43354 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
NR4A2P43354 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NR4A2P43354 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NR4A2P43354 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NR4A2P43354 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NR4A2P43354 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NR4A2P43354 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NR4A2P43354 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NR4A2P43354 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NR4A2P43354 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NR4A2P43354 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NR4A2P43354 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NR4A2P43354 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NR4A2P43354 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NR4A2P43354 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NR4A2P43354 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NR4A2P43354 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NR4A2P43354 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NR4A2P43354 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
NR4A2P43354 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NR4A2P43354 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NR4A2P43354 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms