Protein–RNA interactions for Protein: P35609

ACTN2, Alpha-actinin-2, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN2P35609 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
ACTN2P35609 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ACTN2P35609 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
ACTN2P35609 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
ACTN2P35609 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ACTN2P35609 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ACTN2P35609 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ACTN2P35609 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ACTN2P35609 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
ACTN2P35609 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ACTN2P35609 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ACTN2P35609 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ACTN2P35609 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ACTN2P35609 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ACTN2P35609 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ACTN2P35609 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ACTN2P35609 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ACTN2P35609 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ACTN2P35609 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ACTN2P35609 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ACTN2P35609 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ACTN2P35609 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ACTN2P35609 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
ACTN2P35609 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ACTN2P35609 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ACTN2P35609 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
ACTN2P35609 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
ACTN2P35609 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
ACTN2P35609 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ACTN2P35609 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ACTN2P35609 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ACTN2P35609 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
ACTN2P35609 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ACTN2P35609 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ACTN2P35609 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ACTN2P35609 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ACTN2P35609 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ACTN2P35609 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ACTN2P35609 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ACTN2P35609 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ACTN2P35609 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ACTN2P35609 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ACTN2P35609 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ACTN2P35609 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ACTN2P35609 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ACTN2P35609 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ACTN2P35609 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ACTN2P35609 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ACTN2P35609 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
ACTN2P35609 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ACTN2P35609 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ACTN2P35609 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ACTN2P35609 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.2
ACTN2P35609 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
ACTN2P35609 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
ACTN2P35609 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
ACTN2P35609 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ACTN2P35609 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ACTN2P35609 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ACTN2P35609 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
ACTN2P35609 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ACTN2P35609 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
ACTN2P35609 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ACTN2P35609 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ACTN2P35609 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
ACTN2P35609 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
ACTN2P35609 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
ACTN2P35609 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
ACTN2P35609 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ACTN2P35609 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ACTN2P35609 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ACTN2P35609 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
ACTN2P35609 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ACTN2P35609 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ACTN2P35609 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ACTN2P35609 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ACTN2P35609 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ACTN2P35609 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
ACTN2P35609 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ACTN2P35609 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
ACTN2P35609 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
ACTN2P35609 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
ACTN2P35609 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ACTN2P35609 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ACTN2P35609 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ACTN2P35609 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ACTN2P35609 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
ACTN2P35609 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
ACTN2P35609 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ACTN2P35609 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ACTN2P35609 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
ACTN2P35609 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ACTN2P35609 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ACTN2P35609 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ACTN2P35609 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
ACTN2P35609 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
ACTN2P35609 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ACTN2P35609 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ACTN2P35609 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ACTN2P35609 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms