Protein–RNA interactions for Protein: P29323

EPHB2, Ephrin type-B receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB2P29323 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
EPHB2P29323 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
EPHB2P29323 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
EPHB2P29323 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
EPHB2P29323 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
EPHB2P29323 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
EPHB2P29323 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
EPHB2P29323 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
EPHB2P29323 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
EPHB2P29323 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
EPHB2P29323 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
EPHB2P29323 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
EPHB2P29323 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
EPHB2P29323 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
EPHB2P29323 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
EPHB2P29323 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
EPHB2P29323 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
EPHB2P29323 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
EPHB2P29323 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
EPHB2P29323 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
EPHB2P29323 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
EPHB2P29323 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
EPHB2P29323 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
EPHB2P29323 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
EPHB2P29323 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
EPHB2P29323 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
EPHB2P29323 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
EPHB2P29323 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
EPHB2P29323 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
EPHB2P29323 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
EPHB2P29323 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
EPHB2P29323 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
EPHB2P29323 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
EPHB2P29323 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
EPHB2P29323 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
EPHB2P29323 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
EPHB2P29323 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
EPHB2P29323 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
EPHB2P29323 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
EPHB2P29323 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
EPHB2P29323 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
EPHB2P29323 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
EPHB2P29323 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
EPHB2P29323 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
EPHB2P29323 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
EPHB2P29323 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
EPHB2P29323 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
EPHB2P29323 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
EPHB2P29323 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
EPHB2P29323 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
EPHB2P29323 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
EPHB2P29323 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
EPHB2P29323 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
EPHB2P29323 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
EPHB2P29323 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
EPHB2P29323 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
EPHB2P29323 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
EPHB2P29323 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
EPHB2P29323 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
EPHB2P29323 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
EPHB2P29323 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
EPHB2P29323 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
EPHB2P29323 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
EPHB2P29323 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
EPHB2P29323 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
EPHB2P29323 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
EPHB2P29323 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
EPHB2P29323 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
EPHB2P29323 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
EPHB2P29323 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
EPHB2P29323 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
EPHB2P29323 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
EPHB2P29323 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
EPHB2P29323 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
EPHB2P29323 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC28.35■■■□□ 2.13
EPHB2P29323 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
EPHB2P29323 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
EPHB2P29323 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
EPHB2P29323 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
EPHB2P29323 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
EPHB2P29323 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
EPHB2P29323 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
EPHB2P29323 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
EPHB2P29323 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
EPHB2P29323 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
EPHB2P29323 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
EPHB2P29323 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
EPHB2P29323 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
EPHB2P29323 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
EPHB2P29323 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
EPHB2P29323 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
EPHB2P29323 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
EPHB2P29323 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
EPHB2P29323 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
EPHB2P29323 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
EPHB2P29323 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
EPHB2P29323 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
EPHB2P29323 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
EPHB2P29323 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
EPHB2P29323 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms