Protein–RNA interactions for Protein: P20337

RAB3B, Ras-related protein Rab-3B, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3BP20337 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RAB3BP20337 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAB3BP20337 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAB3BP20337 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAB3BP20337 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAB3BP20337 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RAB3BP20337 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
RAB3BP20337 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAB3BP20337 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAB3BP20337 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAB3BP20337 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAB3BP20337 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAB3BP20337 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAB3BP20337 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAB3BP20337 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAB3BP20337 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAB3BP20337 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAB3BP20337 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAB3BP20337 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
RAB3BP20337 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAB3BP20337 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAB3BP20337 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAB3BP20337 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAB3BP20337 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAB3BP20337 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAB3BP20337 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAB3BP20337 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAB3BP20337 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAB3BP20337 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAB3BP20337 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAB3BP20337 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAB3BP20337 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAB3BP20337 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAB3BP20337 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RAB3BP20337 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RAB3BP20337 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAB3BP20337 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAB3BP20337 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RAB3BP20337 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
RAB3BP20337 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RAB3BP20337 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
RAB3BP20337 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAB3BP20337 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAB3BP20337 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAB3BP20337 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAB3BP20337 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
RAB3BP20337 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAB3BP20337 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAB3BP20337 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RAB3BP20337 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RAB3BP20337 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAB3BP20337 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAB3BP20337 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAB3BP20337 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAB3BP20337 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAB3BP20337 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAB3BP20337 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAB3BP20337 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAB3BP20337 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAB3BP20337 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAB3BP20337 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAB3BP20337 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAB3BP20337 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAB3BP20337 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAB3BP20337 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAB3BP20337 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAB3BP20337 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAB3BP20337 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAB3BP20337 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RAB3BP20337 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RAB3BP20337 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RAB3BP20337 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RAB3BP20337 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RAB3BP20337 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RAB3BP20337 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RAB3BP20337 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RAB3BP20337 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RAB3BP20337 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RAB3BP20337 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RAB3BP20337 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RAB3BP20337 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RAB3BP20337 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RAB3BP20337 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RAB3BP20337 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RAB3BP20337 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RAB3BP20337 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RAB3BP20337 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RAB3BP20337 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RAB3BP20337 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RAB3BP20337 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RAB3BP20337 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAB3BP20337 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAB3BP20337 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RAB3BP20337 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RAB3BP20337 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
RAB3BP20337 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RAB3BP20337 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RAB3BP20337 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
RAB3BP20337 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RAB3BP20337 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms