Protein–RNA interactions for Protein: P16220

CREB1, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB1P16220 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CREB1P16220 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CREB1P16220 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CREB1P16220 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CREB1P16220 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CREB1P16220 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CREB1P16220 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CREB1P16220 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CREB1P16220 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CREB1P16220 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
CREB1P16220 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CREB1P16220 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CREB1P16220 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CREB1P16220 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
CREB1P16220 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CREB1P16220 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
CREB1P16220 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CREB1P16220 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CREB1P16220 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CREB1P16220 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CREB1P16220 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
CREB1P16220 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CREB1P16220 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CREB1P16220 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CREB1P16220 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CREB1P16220 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CREB1P16220 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CREB1P16220 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CREB1P16220 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.05
CREB1P16220 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CREB1P16220 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CREB1P16220 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CREB1P16220 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CREB1P16220 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CREB1P16220 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CREB1P16220 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CREB1P16220 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CREB1P16220 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CREB1P16220 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
CREB1P16220 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CREB1P16220 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CREB1P16220 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CREB1P16220 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CREB1P16220 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CREB1P16220 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
CREB1P16220 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CREB1P16220 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CREB1P16220 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CREB1P16220 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CREB1P16220 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CREB1P16220 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CREB1P16220 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CREB1P16220 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CREB1P16220 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CREB1P16220 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CREB1P16220 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CREB1P16220 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CREB1P16220 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CREB1P16220 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CREB1P16220 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CREB1P16220 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CREB1P16220 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CREB1P16220 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CREB1P16220 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
CREB1P16220 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CREB1P16220 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CREB1P16220 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CREB1P16220 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CREB1P16220 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
CREB1P16220 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CREB1P16220 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CREB1P16220 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CREB1P16220 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CREB1P16220 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CREB1P16220 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CREB1P16220 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
CREB1P16220 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
CREB1P16220 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CREB1P16220 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CREB1P16220 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CREB1P16220 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CREB1P16220 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CREB1P16220 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CREB1P16220 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
CREB1P16220 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CREB1P16220 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CREB1P16220 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CREB1P16220 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CREB1P16220 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CREB1P16220 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CREB1P16220 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CREB1P16220 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CREB1P16220 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CREB1P16220 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CREB1P16220 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CREB1P16220 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CREB1P16220 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CREB1P16220 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CREB1P16220 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CREB1P16220 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms