Protein–RNA interactions for Protein: P10966

CD8B, T-cell surface glycoprotein CD8 beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD8BP10966 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CD8BP10966 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CD8BP10966 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CD8BP10966 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CD8BP10966 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CD8BP10966 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CD8BP10966 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CD8BP10966 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CD8BP10966 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CD8BP10966 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CD8BP10966 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CD8BP10966 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CD8BP10966 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CD8BP10966 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CD8BP10966 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CD8BP10966 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CD8BP10966 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CD8BP10966 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CD8BP10966 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CD8BP10966 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CD8BP10966 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CD8BP10966 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CD8BP10966 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CD8BP10966 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CD8BP10966 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CD8BP10966 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CD8BP10966 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CD8BP10966 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CD8BP10966 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CD8BP10966 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CD8BP10966 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CD8BP10966 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CD8BP10966 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CD8BP10966 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CD8BP10966 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CD8BP10966 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CD8BP10966 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CD8BP10966 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CD8BP10966 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CD8BP10966 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CD8BP10966 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CD8BP10966 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CD8BP10966 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CD8BP10966 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CD8BP10966 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CD8BP10966 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CD8BP10966 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CD8BP10966 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CD8BP10966 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CD8BP10966 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CD8BP10966 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CD8BP10966 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CD8BP10966 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CD8BP10966 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CD8BP10966 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CD8BP10966 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CD8BP10966 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CD8BP10966 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.59
CD8BP10966 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CD8BP10966 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CD8BP10966 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CD8BP10966 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CD8BP10966 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CD8BP10966 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CD8BP10966 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CD8BP10966 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CD8BP10966 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CD8BP10966 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CD8BP10966 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CD8BP10966 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CD8BP10966 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CD8BP10966 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CD8BP10966 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CD8BP10966 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CD8BP10966 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CD8BP10966 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CD8BP10966 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CD8BP10966 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CD8BP10966 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CD8BP10966 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CD8BP10966 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CD8BP10966 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CD8BP10966 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CD8BP10966 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CD8BP10966 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CD8BP10966 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CD8BP10966 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CD8BP10966 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CD8BP10966 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CD8BP10966 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CD8BP10966 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CD8BP10966 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CD8BP10966 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CD8BP10966 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CD8BP10966 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CD8BP10966 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CD8BP10966 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CD8BP10966 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CD8BP10966 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CD8BP10966 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms