Protein–RNA interactions for Protein: P10966

CD8B, T-cell surface glycoprotein CD8 beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD8BP10966 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC30.41■■■□□ 2.46
CD8BP10966 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CD8BP10966 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CD8BP10966 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
CD8BP10966 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CD8BP10966 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CD8BP10966 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CD8BP10966 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CD8BP10966 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CD8BP10966 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
CD8BP10966 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CD8BP10966 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CD8BP10966 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CD8BP10966 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CD8BP10966 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CD8BP10966 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CD8BP10966 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CD8BP10966 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CD8BP10966 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CD8BP10966 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CD8BP10966 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CD8BP10966 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CD8BP10966 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CD8BP10966 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CD8BP10966 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CD8BP10966 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CD8BP10966 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CD8BP10966 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CD8BP10966 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CD8BP10966 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CD8BP10966 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
CD8BP10966 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CD8BP10966 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CD8BP10966 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CD8BP10966 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CD8BP10966 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CD8BP10966 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CD8BP10966 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CD8BP10966 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CD8BP10966 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CD8BP10966 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CD8BP10966 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CD8BP10966 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CD8BP10966 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CD8BP10966 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CD8BP10966 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CD8BP10966 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CD8BP10966 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CD8BP10966 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CD8BP10966 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CD8BP10966 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CD8BP10966 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CD8BP10966 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CD8BP10966 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CD8BP10966 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CD8BP10966 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
CD8BP10966 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CD8BP10966 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CD8BP10966 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CD8BP10966 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CD8BP10966 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CD8BP10966 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CD8BP10966 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CD8BP10966 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CD8BP10966 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
CD8BP10966 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CD8BP10966 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CD8BP10966 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CD8BP10966 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CD8BP10966 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CD8BP10966 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CD8BP10966 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
CD8BP10966 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CD8BP10966 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CD8BP10966 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CD8BP10966 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CD8BP10966 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CD8BP10966 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CD8BP10966 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.84
CD8BP10966 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CD8BP10966 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CD8BP10966 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CD8BP10966 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CD8BP10966 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CD8BP10966 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CD8BP10966 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CD8BP10966 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CD8BP10966 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CD8BP10966 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CD8BP10966 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CD8BP10966 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CD8BP10966 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CD8BP10966 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CD8BP10966 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CD8BP10966 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CD8BP10966 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CD8BP10966 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CD8BP10966 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CD8BP10966 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CD8BP10966 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.9 ms