Protein–RNA interactions for Protein: P0CB38

PABPC4L, Polyadenylate-binding protein 4-like, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC4LP0CB38 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PABPC4LP0CB38 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PABPC4LP0CB38 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PABPC4LP0CB38 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PABPC4LP0CB38 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PABPC4LP0CB38 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PABPC4LP0CB38 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PABPC4LP0CB38 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PABPC4LP0CB38 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PABPC4LP0CB38 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PABPC4LP0CB38 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PABPC4LP0CB38 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PABPC4LP0CB38 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PABPC4LP0CB38 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PABPC4LP0CB38 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PABPC4LP0CB38 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PABPC4LP0CB38 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PABPC4LP0CB38 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PABPC4LP0CB38 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PABPC4LP0CB38 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PABPC4LP0CB38 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PABPC4LP0CB38 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PABPC4LP0CB38 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PABPC4LP0CB38 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PABPC4LP0CB38 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PABPC4LP0CB38 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PABPC4LP0CB38 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PABPC4LP0CB38 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PABPC4LP0CB38 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PABPC4LP0CB38 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
PABPC4LP0CB38 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PABPC4LP0CB38 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PABPC4LP0CB38 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PABPC4LP0CB38 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PABPC4LP0CB38 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PABPC4LP0CB38 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PABPC4LP0CB38 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PABPC4LP0CB38 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
PABPC4LP0CB38 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PABPC4LP0CB38 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PABPC4LP0CB38 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PABPC4LP0CB38 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PABPC4LP0CB38 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
PABPC4LP0CB38 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PABPC4LP0CB38 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PABPC4LP0CB38 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PABPC4LP0CB38 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PABPC4LP0CB38 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PABPC4LP0CB38 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PABPC4LP0CB38 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PABPC4LP0CB38 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PABPC4LP0CB38 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PABPC4LP0CB38 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PABPC4LP0CB38 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PABPC4LP0CB38 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PABPC4LP0CB38 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PABPC4LP0CB38 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PABPC4LP0CB38 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PABPC4LP0CB38 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PABPC4LP0CB38 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PABPC4LP0CB38 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PABPC4LP0CB38 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PABPC4LP0CB38 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PABPC4LP0CB38 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PABPC4LP0CB38 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PABPC4LP0CB38 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PABPC4LP0CB38 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PABPC4LP0CB38 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PABPC4LP0CB38 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PABPC4LP0CB38 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PABPC4LP0CB38 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PABPC4LP0CB38 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PABPC4LP0CB38 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PABPC4LP0CB38 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PABPC4LP0CB38 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PABPC4LP0CB38 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PABPC4LP0CB38 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PABPC4LP0CB38 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PABPC4LP0CB38 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
PABPC4LP0CB38 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PABPC4LP0CB38 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PABPC4LP0CB38 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PABPC4LP0CB38 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PABPC4LP0CB38 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PABPC4LP0CB38 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PABPC4LP0CB38 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PABPC4LP0CB38 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PABPC4LP0CB38 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PABPC4LP0CB38 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PABPC4LP0CB38 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PABPC4LP0CB38 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PABPC4LP0CB38 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PABPC4LP0CB38 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PABPC4LP0CB38 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PABPC4LP0CB38 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PABPC4LP0CB38 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PABPC4LP0CB38 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PABPC4LP0CB38 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PABPC4LP0CB38 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PABPC4LP0CB38 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms