Protein–RNA interactions for Protein: P07437

TUBB, Tubulin beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBBP07437 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
TUBBP07437 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TUBBP07437 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
TUBBP07437 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TUBBP07437 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
TUBBP07437 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.28
TUBBP07437 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
TUBBP07437 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
TUBBP07437 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
TUBBP07437 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TUBBP07437 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
TUBBP07437 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TUBBP07437 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TUBBP07437 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TUBBP07437 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TUBBP07437 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
TUBBP07437 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TUBBP07437 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TUBBP07437 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TUBBP07437 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TUBBP07437 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TUBBP07437 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.25
TUBBP07437 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TUBBP07437 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TUBBP07437 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TUBBP07437 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TUBBP07437 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TUBBP07437 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TUBBP07437 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
TUBBP07437 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TUBBP07437 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TUBBP07437 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TUBBP07437 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TUBBP07437 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
TUBBP07437 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TUBBP07437 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TUBBP07437 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TUBBP07437 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TUBBP07437 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TUBBP07437 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TUBBP07437 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TUBBP07437 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.23
TUBBP07437 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
TUBBP07437 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
TUBBP07437 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
TUBBP07437 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TUBBP07437 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
TUBBP07437 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
TUBBP07437 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TUBBP07437 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TUBBP07437 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TUBBP07437 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TUBBP07437 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
TUBBP07437 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TUBBP07437 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
TUBBP07437 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TUBBP07437 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
TUBBP07437 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TUBBP07437 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TUBBP07437 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TUBBP07437 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TUBBP07437 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TUBBP07437 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TUBBP07437 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TUBBP07437 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TUBBP07437 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TUBBP07437 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TUBBP07437 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TUBBP07437 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TUBBP07437 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TUBBP07437 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TUBBP07437 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TUBBP07437 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TUBBP07437 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TUBBP07437 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TUBBP07437 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TUBBP07437 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TUBBP07437 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
TUBBP07437 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TUBBP07437 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
TUBBP07437 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
TUBBP07437 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
TUBBP07437 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
TUBBP07437 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
TUBBP07437 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
TUBBP07437 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.17
TUBBP07437 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TUBBP07437 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
TUBBP07437 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
TUBBP07437 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TUBBP07437 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TUBBP07437 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
TUBBP07437 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TUBBP07437 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TUBBP07437 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TUBBP07437 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TUBBP07437 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TUBBP07437 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TUBBP07437 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TUBBP07437 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms