Protein–RNA interactions for Protein: O95744

PMS2P2, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P2O95744 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PMS2P2O95744 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PMS2P2O95744 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PMS2P2O95744 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PMS2P2O95744 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PMS2P2O95744 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PMS2P2O95744 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PMS2P2O95744 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PMS2P2O95744 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PMS2P2O95744 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PMS2P2O95744 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PMS2P2O95744 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PMS2P2O95744 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PMS2P2O95744 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PMS2P2O95744 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PMS2P2O95744 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PMS2P2O95744 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PMS2P2O95744 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PMS2P2O95744 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PMS2P2O95744 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PMS2P2O95744 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PMS2P2O95744 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PMS2P2O95744 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PMS2P2O95744 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PMS2P2O95744 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PMS2P2O95744 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PMS2P2O95744 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PMS2P2O95744 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PMS2P2O95744 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PMS2P2O95744 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PMS2P2O95744 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PMS2P2O95744 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PMS2P2O95744 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PMS2P2O95744 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PMS2P2O95744 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PMS2P2O95744 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PMS2P2O95744 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PMS2P2O95744 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PMS2P2O95744 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PMS2P2O95744 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PMS2P2O95744 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PMS2P2O95744 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PMS2P2O95744 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PMS2P2O95744 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PMS2P2O95744 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PMS2P2O95744 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PMS2P2O95744 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PMS2P2O95744 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PMS2P2O95744 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PMS2P2O95744 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PMS2P2O95744 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PMS2P2O95744 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PMS2P2O95744 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PMS2P2O95744 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PMS2P2O95744 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PMS2P2O95744 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PMS2P2O95744 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PMS2P2O95744 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PMS2P2O95744 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PMS2P2O95744 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PMS2P2O95744 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PMS2P2O95744 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PMS2P2O95744 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PMS2P2O95744 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PMS2P2O95744 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PMS2P2O95744 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PMS2P2O95744 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PMS2P2O95744 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PMS2P2O95744 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PMS2P2O95744 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
PMS2P2O95744 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PMS2P2O95744 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PMS2P2O95744 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PMS2P2O95744 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PMS2P2O95744 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PMS2P2O95744 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PMS2P2O95744 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PMS2P2O95744 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PMS2P2O95744 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PMS2P2O95744 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PMS2P2O95744 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PMS2P2O95744 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PMS2P2O95744 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PMS2P2O95744 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PMS2P2O95744 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PMS2P2O95744 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PMS2P2O95744 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PMS2P2O95744 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PMS2P2O95744 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PMS2P2O95744 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PMS2P2O95744 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PMS2P2O95744 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PMS2P2O95744 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PMS2P2O95744 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PMS2P2O95744 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PMS2P2O95744 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PMS2P2O95744 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PMS2P2O95744 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PMS2P2O95744 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PMS2P2O95744 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 158.4 ms