Protein–RNA interactions for Protein: O75382

TRIM3, Tripartite motif-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM3O75382 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRIM3O75382 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRIM3O75382 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRIM3O75382 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRIM3O75382 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRIM3O75382 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRIM3O75382 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRIM3O75382 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
TRIM3O75382 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRIM3O75382 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRIM3O75382 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRIM3O75382 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRIM3O75382 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
TRIM3O75382 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRIM3O75382 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRIM3O75382 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRIM3O75382 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRIM3O75382 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRIM3O75382 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRIM3O75382 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRIM3O75382 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRIM3O75382 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRIM3O75382 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRIM3O75382 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRIM3O75382 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRIM3O75382 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRIM3O75382 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRIM3O75382 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRIM3O75382 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRIM3O75382 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIM3O75382 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
TRIM3O75382 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRIM3O75382 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRIM3O75382 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRIM3O75382 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIM3O75382 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIM3O75382 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIM3O75382 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRIM3O75382 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRIM3O75382 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRIM3O75382 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRIM3O75382 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRIM3O75382 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRIM3O75382 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRIM3O75382 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRIM3O75382 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRIM3O75382 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRIM3O75382 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRIM3O75382 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRIM3O75382 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRIM3O75382 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
TRIM3O75382 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRIM3O75382 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRIM3O75382 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
TRIM3O75382 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRIM3O75382 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRIM3O75382 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRIM3O75382 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRIM3O75382 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIM3O75382 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIM3O75382 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIM3O75382 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
TRIM3O75382 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIM3O75382 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIM3O75382 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIM3O75382 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIM3O75382 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIM3O75382 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIM3O75382 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRIM3O75382 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRIM3O75382 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRIM3O75382 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRIM3O75382 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRIM3O75382 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRIM3O75382 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIM3O75382 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIM3O75382 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRIM3O75382 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRIM3O75382 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRIM3O75382 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRIM3O75382 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRIM3O75382 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRIM3O75382 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRIM3O75382 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRIM3O75382 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRIM3O75382 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRIM3O75382 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRIM3O75382 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRIM3O75382 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRIM3O75382 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRIM3O75382 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRIM3O75382 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRIM3O75382 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
TRIM3O75382 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
TRIM3O75382 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRIM3O75382 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRIM3O75382 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRIM3O75382 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
TRIM3O75382 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRIM3O75382 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms