Protein–RNA interactions for Protein: O43189

PHF1, PHD finger protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF1O43189 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PHF1O43189 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PHF1O43189 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
PHF1O43189 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PHF1O43189 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PHF1O43189 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PHF1O43189 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PHF1O43189 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PHF1O43189 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
PHF1O43189 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PHF1O43189 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PHF1O43189 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PHF1O43189 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PHF1O43189 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PHF1O43189 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PHF1O43189 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PHF1O43189 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PHF1O43189 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PHF1O43189 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PHF1O43189 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PHF1O43189 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PHF1O43189 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PHF1O43189 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PHF1O43189 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PHF1O43189 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PHF1O43189 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PHF1O43189 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PHF1O43189 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PHF1O43189 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PHF1O43189 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PHF1O43189 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PHF1O43189 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PHF1O43189 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PHF1O43189 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PHF1O43189 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PHF1O43189 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PHF1O43189 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PHF1O43189 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PHF1O43189 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PHF1O43189 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PHF1O43189 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PHF1O43189 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PHF1O43189 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PHF1O43189 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PHF1O43189 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PHF1O43189 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PHF1O43189 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PHF1O43189 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PHF1O43189 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PHF1O43189 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PHF1O43189 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PHF1O43189 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PHF1O43189 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PHF1O43189 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PHF1O43189 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PHF1O43189 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PHF1O43189 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PHF1O43189 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PHF1O43189 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PHF1O43189 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PHF1O43189 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PHF1O43189 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PHF1O43189 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PHF1O43189 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PHF1O43189 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PHF1O43189 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PHF1O43189 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PHF1O43189 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PHF1O43189 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PHF1O43189 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PHF1O43189 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PHF1O43189 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PHF1O43189 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PHF1O43189 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PHF1O43189 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PHF1O43189 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PHF1O43189 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PHF1O43189 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PHF1O43189 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PHF1O43189 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PHF1O43189 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PHF1O43189 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PHF1O43189 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PHF1O43189 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PHF1O43189 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PHF1O43189 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PHF1O43189 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PHF1O43189 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PHF1O43189 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PHF1O43189 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PHF1O43189 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PHF1O43189 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PHF1O43189 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PHF1O43189 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PHF1O43189 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PHF1O43189 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PHF1O43189 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PHF1O43189 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PHF1O43189 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PHF1O43189 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms