Protein–RNA interactions for Protein: O15120

AGPAT2, 1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase beta, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGPAT2O15120 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
AGPAT2O15120 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
AGPAT2O15120 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
AGPAT2O15120 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
AGPAT2O15120 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
AGPAT2O15120 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
AGPAT2O15120 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
AGPAT2O15120 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
AGPAT2O15120 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
AGPAT2O15120 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
AGPAT2O15120 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
AGPAT2O15120 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
AGPAT2O15120 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
AGPAT2O15120 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AGPAT2O15120 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
AGPAT2O15120 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
AGPAT2O15120 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
AGPAT2O15120 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
AGPAT2O15120 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
AGPAT2O15120 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
AGPAT2O15120 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AGPAT2O15120 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AGPAT2O15120 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AGPAT2O15120 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AGPAT2O15120 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AGPAT2O15120 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AGPAT2O15120 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
AGPAT2O15120 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AGPAT2O15120 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
AGPAT2O15120 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
AGPAT2O15120 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
AGPAT2O15120 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
AGPAT2O15120 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
AGPAT2O15120 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AGPAT2O15120 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AGPAT2O15120 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
AGPAT2O15120 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
AGPAT2O15120 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AGPAT2O15120 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AGPAT2O15120 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AGPAT2O15120 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
AGPAT2O15120 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AGPAT2O15120 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AGPAT2O15120 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AGPAT2O15120 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AGPAT2O15120 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AGPAT2O15120 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
AGPAT2O15120 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
AGPAT2O15120 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
AGPAT2O15120 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
AGPAT2O15120 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AGPAT2O15120 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AGPAT2O15120 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AGPAT2O15120 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AGPAT2O15120 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AGPAT2O15120 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AGPAT2O15120 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
AGPAT2O15120 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
AGPAT2O15120 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
AGPAT2O15120 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
AGPAT2O15120 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AGPAT2O15120 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AGPAT2O15120 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
AGPAT2O15120 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
AGPAT2O15120 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AGPAT2O15120 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AGPAT2O15120 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AGPAT2O15120 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AGPAT2O15120 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AGPAT2O15120 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AGPAT2O15120 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AGPAT2O15120 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AGPAT2O15120 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
AGPAT2O15120 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
AGPAT2O15120 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AGPAT2O15120 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AGPAT2O15120 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AGPAT2O15120 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AGPAT2O15120 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AGPAT2O15120 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AGPAT2O15120 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
AGPAT2O15120 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
AGPAT2O15120 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AGPAT2O15120 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AGPAT2O15120 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
AGPAT2O15120 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AGPAT2O15120 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AGPAT2O15120 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AGPAT2O15120 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AGPAT2O15120 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
AGPAT2O15120 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
AGPAT2O15120 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
AGPAT2O15120 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AGPAT2O15120 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
AGPAT2O15120 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AGPAT2O15120 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AGPAT2O15120 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AGPAT2O15120 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
AGPAT2O15120 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AGPAT2O15120 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms