Protein–RNA interactions for Protein: O14967

CLGN, Calmegin, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLGNO14967 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CLGNO14967 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CLGNO14967 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CLGNO14967 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CLGNO14967 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CLGNO14967 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CLGNO14967 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CLGNO14967 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CLGNO14967 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CLGNO14967 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CLGNO14967 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CLGNO14967 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CLGNO14967 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CLGNO14967 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CLGNO14967 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CLGNO14967 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CLGNO14967 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CLGNO14967 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CLGNO14967 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CLGNO14967 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CLGNO14967 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CLGNO14967 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CLGNO14967 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CLGNO14967 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CLGNO14967 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CLGNO14967 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CLGNO14967 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CLGNO14967 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CLGNO14967 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CLGNO14967 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CLGNO14967 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CLGNO14967 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CLGNO14967 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CLGNO14967 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CLGNO14967 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
CLGNO14967 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CLGNO14967 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CLGNO14967 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CLGNO14967 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CLGNO14967 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CLGNO14967 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CLGNO14967 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CLGNO14967 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CLGNO14967 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CLGNO14967 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CLGNO14967 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
CLGNO14967 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CLGNO14967 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CLGNO14967 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CLGNO14967 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CLGNO14967 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CLGNO14967 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CLGNO14967 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CLGNO14967 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CLGNO14967 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CLGNO14967 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CLGNO14967 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CLGNO14967 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CLGNO14967 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CLGNO14967 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CLGNO14967 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CLGNO14967 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CLGNO14967 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CLGNO14967 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CLGNO14967 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CLGNO14967 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CLGNO14967 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CLGNO14967 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CLGNO14967 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CLGNO14967 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CLGNO14967 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CLGNO14967 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CLGNO14967 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CLGNO14967 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CLGNO14967 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.91
CLGNO14967 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
CLGNO14967 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CLGNO14967 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CLGNO14967 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CLGNO14967 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CLGNO14967 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CLGNO14967 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CLGNO14967 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CLGNO14967 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CLGNO14967 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CLGNO14967 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CLGNO14967 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CLGNO14967 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CLGNO14967 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CLGNO14967 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CLGNO14967 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CLGNO14967 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CLGNO14967 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CLGNO14967 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CLGNO14967 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CLGNO14967 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CLGNO14967 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CLGNO14967 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CLGNO14967 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CLGNO14967 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms