Protein–RNA interactions for Protein: O14727

APAF1, Apoptotic protease-activating factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APAF1O14727 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
APAF1O14727 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC36.82■■■■□ 3.48
APAF1O14727 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
APAF1O14727 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC36.8■■■■□ 3.48
APAF1O14727 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
APAF1O14727 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.79■■■■□ 3.48
APAF1O14727 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
APAF1O14727 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
APAF1O14727 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC36.76■■■■□ 3.48
APAF1O14727 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC36.76■■■■□ 3.48
APAF1O14727 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
APAF1O14727 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
APAF1O14727 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
APAF1O14727 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
APAF1O14727 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
APAF1O14727 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
APAF1O14727 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC36.72■■■■□ 3.47
APAF1O14727 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC36.72■■■■□ 3.47
APAF1O14727 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC36.71■■■■□ 3.47
APAF1O14727 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC36.7■■■■□ 3.47
APAF1O14727 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
APAF1O14727 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC36.67■■■■□ 3.46
APAF1O14727 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
APAF1O14727 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC36.66■■■■□ 3.46
APAF1O14727 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC36.65■■■■□ 3.46
APAF1O14727 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
APAF1O14727 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC36.63■■■■□ 3.45
APAF1O14727 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
APAF1O14727 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
APAF1O14727 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC36.6■■■■□ 3.45
APAF1O14727 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
APAF1O14727 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
APAF1O14727 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.54■■■■□ 3.44
APAF1O14727 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC36.52■■■■□ 3.44
APAF1O14727 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
APAF1O14727 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC36.5■■■■□ 3.43
APAF1O14727 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC36.49■■■■□ 3.43
APAF1O14727 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.48■■■■□ 3.43
APAF1O14727 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
APAF1O14727 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC36.47■■■■□ 3.43
APAF1O14727 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC36.46■■■■□ 3.43
APAF1O14727 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC36.46■■■■□ 3.43
APAF1O14727 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC36.45■■■■□ 3.42
APAF1O14727 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
APAF1O14727 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC36.41■■■■□ 3.42
APAF1O14727 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
APAF1O14727 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
APAF1O14727 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
APAF1O14727 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC36.39■■■■□ 3.42
APAF1O14727 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
APAF1O14727 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
APAF1O14727 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
APAF1O14727 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
APAF1O14727 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
APAF1O14727 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC36.34■■■■□ 3.41
APAF1O14727 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC36.33■■■■□ 3.41
APAF1O14727 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
APAF1O14727 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC36.32■■■■□ 3.4
APAF1O14727 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
APAF1O14727 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC36.32■■■■□ 3.4
APAF1O14727 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
APAF1O14727 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
APAF1O14727 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
APAF1O14727 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
APAF1O14727 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC36.29■■■■□ 3.4
APAF1O14727 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
APAF1O14727 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
APAF1O14727 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC36.25■■■■□ 3.39
APAF1O14727 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
APAF1O14727 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
APAF1O14727 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.22■■■■□ 3.39
APAF1O14727 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
APAF1O14727 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
APAF1O14727 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
APAF1O14727 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC36.2■■■■□ 3.39
APAF1O14727 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC36.2■■■■□ 3.39
APAF1O14727 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
APAF1O14727 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
APAF1O14727 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
APAF1O14727 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC36.19■■■■□ 3.38
APAF1O14727 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
APAF1O14727 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.16■■■■□ 3.38
APAF1O14727 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC36.14■■■■□ 3.38
APAF1O14727 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
APAF1O14727 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
APAF1O14727 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
APAF1O14727 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
APAF1O14727 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
APAF1O14727 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.07■■■■□ 3.37
APAF1O14727 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.06■■■■□ 3.36
APAF1O14727 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
APAF1O14727 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC36.05■■■■□ 3.36
APAF1O14727 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
APAF1O14727 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
APAF1O14727 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC36.03■■■■□ 3.36
APAF1O14727 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC36.03■■■■□ 3.36
APAF1O14727 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
APAF1O14727 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
APAF1O14727 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC36.01■■■■□ 3.35
APAF1O14727 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36■■■■□ 3.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms