Protein–RNA interactions for Protein: O00295

TULP2, Tubby-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TULP2O00295 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
TULP2O00295 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
TULP2O00295 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
TULP2O00295 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
TULP2O00295 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
TULP2O00295 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
TULP2O00295 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
TULP2O00295 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
TULP2O00295 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
TULP2O00295 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
TULP2O00295 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
TULP2O00295 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
TULP2O00295 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
TULP2O00295 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
TULP2O00295 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
TULP2O00295 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
TULP2O00295 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
TULP2O00295 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
TULP2O00295 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
TULP2O00295 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
TULP2O00295 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
TULP2O00295 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
TULP2O00295 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
TULP2O00295 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
TULP2O00295 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
TULP2O00295 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
TULP2O00295 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
TULP2O00295 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
TULP2O00295 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
TULP2O00295 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
TULP2O00295 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
TULP2O00295 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
TULP2O00295 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
TULP2O00295 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
TULP2O00295 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
TULP2O00295 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
TULP2O00295 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
TULP2O00295 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
TULP2O00295 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
TULP2O00295 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
TULP2O00295 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.32
TULP2O00295 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
TULP2O00295 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
TULP2O00295 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
TULP2O00295 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
TULP2O00295 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
TULP2O00295 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
TULP2O00295 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
TULP2O00295 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
TULP2O00295 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
TULP2O00295 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
TULP2O00295 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
TULP2O00295 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC29.43■■■□□ 2.3
TULP2O00295 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
TULP2O00295 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
TULP2O00295 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
TULP2O00295 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
TULP2O00295 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
TULP2O00295 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
TULP2O00295 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
TULP2O00295 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
TULP2O00295 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
TULP2O00295 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
TULP2O00295 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
TULP2O00295 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
TULP2O00295 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
TULP2O00295 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TULP2O00295 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
TULP2O00295 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
TULP2O00295 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
TULP2O00295 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
TULP2O00295 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TULP2O00295 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
TULP2O00295 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
TULP2O00295 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TULP2O00295 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TULP2O00295 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
TULP2O00295 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TULP2O00295 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TULP2O00295 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TULP2O00295 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TULP2O00295 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TULP2O00295 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TULP2O00295 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TULP2O00295 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TULP2O00295 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
TULP2O00295 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
TULP2O00295 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TULP2O00295 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TULP2O00295 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TULP2O00295 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TULP2O00295 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TULP2O00295 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
TULP2O00295 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
TULP2O00295 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
TULP2O00295 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TULP2O00295 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
TULP2O00295 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TULP2O00295 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TULP2O00295 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms