Protein–RNA interactions for Protein: A6NI03

TRIM64B, Putative tripartite motif-containing protein 64B, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM64BA6NI03 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRIM64BA6NI03 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRIM64BA6NI03 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRIM64BA6NI03 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRIM64BA6NI03 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRIM64BA6NI03 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRIM64BA6NI03 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRIM64BA6NI03 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRIM64BA6NI03 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRIM64BA6NI03 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRIM64BA6NI03 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
TRIM64BA6NI03 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRIM64BA6NI03 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
TRIM64BA6NI03 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRIM64BA6NI03 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRIM64BA6NI03 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
TRIM64BA6NI03 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRIM64BA6NI03 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRIM64BA6NI03 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRIM64BA6NI03 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRIM64BA6NI03 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRIM64BA6NI03 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRIM64BA6NI03 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRIM64BA6NI03 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRIM64BA6NI03 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRIM64BA6NI03 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRIM64BA6NI03 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRIM64BA6NI03 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRIM64BA6NI03 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRIM64BA6NI03 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRIM64BA6NI03 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
TRIM64BA6NI03 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
TRIM64BA6NI03 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIM64BA6NI03 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIM64BA6NI03 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRIM64BA6NI03 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIM64BA6NI03 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRIM64BA6NI03 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRIM64BA6NI03 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRIM64BA6NI03 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
TRIM64BA6NI03 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRIM64BA6NI03 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRIM64BA6NI03 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRIM64BA6NI03 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRIM64BA6NI03 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRIM64BA6NI03 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRIM64BA6NI03 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRIM64BA6NI03 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRIM64BA6NI03 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRIM64BA6NI03 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRIM64BA6NI03 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRIM64BA6NI03 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRIM64BA6NI03 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRIM64BA6NI03 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIM64BA6NI03 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIM64BA6NI03 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRIM64BA6NI03 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIM64BA6NI03 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIM64BA6NI03 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIM64BA6NI03 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIM64BA6NI03 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRIM64BA6NI03 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRIM64BA6NI03 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRIM64BA6NI03 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRIM64BA6NI03 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRIM64BA6NI03 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIM64BA6NI03 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIM64BA6NI03 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRIM64BA6NI03 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRIM64BA6NI03 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRIM64BA6NI03 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRIM64BA6NI03 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRIM64BA6NI03 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRIM64BA6NI03 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRIM64BA6NI03 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRIM64BA6NI03 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRIM64BA6NI03 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRIM64BA6NI03 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRIM64BA6NI03 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRIM64BA6NI03 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRIM64BA6NI03 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRIM64BA6NI03 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRIM64BA6NI03 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRIM64BA6NI03 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRIM64BA6NI03 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRIM64BA6NI03 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRIM64BA6NI03 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRIM64BA6NI03 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRIM64BA6NI03 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRIM64BA6NI03 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRIM64BA6NI03 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRIM64BA6NI03 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRIM64BA6NI03 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRIM64BA6NI03 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRIM64BA6NI03 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
TRIM64BA6NI03 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRIM64BA6NI03 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRIM64BA6NI03 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRIM64BA6NI03 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRIM64BA6NI03 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.6 ms