Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WUV0

Uncharacterized protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A087WUV0 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
A0A087WUV0 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
A0A087WUV0 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
A0A087WUV0 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
A0A087WUV0 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
A0A087WUV0 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
A0A087WUV0 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
A0A087WUV0 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
A0A087WUV0 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
A0A087WUV0 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
A0A087WUV0 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
A0A087WUV0 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
A0A087WUV0 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
A0A087WUV0 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
A0A087WUV0 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
A0A087WUV0 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
A0A087WUV0 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
A0A087WUV0 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
A0A087WUV0 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
A0A087WUV0 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
A0A087WUV0 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
A0A087WUV0 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
A0A087WUV0 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
A0A087WUV0 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
A0A087WUV0 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
A0A087WUV0 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
A0A087WUV0 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
A0A087WUV0 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
A0A087WUV0 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
A0A087WUV0 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
A0A087WUV0 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
A0A087WUV0 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
A0A087WUV0 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
A0A087WUV0 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
A0A087WUV0 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
A0A087WUV0 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
A0A087WUV0 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
A0A087WUV0 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
A0A087WUV0 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
A0A087WUV0 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
A0A087WUV0 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
A0A087WUV0 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
A0A087WUV0 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
A0A087WUV0 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
A0A087WUV0 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
A0A087WUV0 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
A0A087WUV0 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
A0A087WUV0 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
A0A087WUV0 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
A0A087WUV0 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
A0A087WUV0 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
A0A087WUV0 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
A0A087WUV0 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
A0A087WUV0 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
A0A087WUV0 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
A0A087WUV0 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
A0A087WUV0 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
A0A087WUV0 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
A0A087WUV0 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
A0A087WUV0 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
A0A087WUV0 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
A0A087WUV0 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
A0A087WUV0 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
A0A087WUV0 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
A0A087WUV0 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
A0A087WUV0 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
A0A087WUV0 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
A0A087WUV0 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
A0A087WUV0 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
A0A087WUV0 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
A0A087WUV0 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
A0A087WUV0 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
A0A087WUV0 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
A0A087WUV0 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
A0A087WUV0 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
A0A087WUV0 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
A0A087WUV0 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
A0A087WUV0 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
A0A087WUV0 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
A0A087WUV0 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
A0A087WUV0 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
A0A087WUV0 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
A0A087WUV0 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
A0A087WUV0 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
A0A087WUV0 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
A0A087WUV0 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
A0A087WUV0 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
A0A087WUV0 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
A0A087WUV0 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
A0A087WUV0 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
A0A087WUV0 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
A0A087WUV0 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
A0A087WUV0 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
A0A087WUV0 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
A0A087WUV0 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.05
A0A087WUV0 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
A0A087WUV0 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
A0A087WUV0 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
A0A087WUV0 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
A0A087WUV0 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms