Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5H5

PCDHA9, Protocadherin alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHA9Q9Y5H5 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PCDHA9Q9Y5H5 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PCDHA9Q9Y5H5 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PCDHA9Q9Y5H5 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PCDHA9Q9Y5H5 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PCDHA9Q9Y5H5 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PCDHA9Q9Y5H5 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PCDHA9Q9Y5H5 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PCDHA9Q9Y5H5 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
PCDHA9Q9Y5H5 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
PCDHA9Q9Y5H5 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PCDHA9Q9Y5H5 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PCDHA9Q9Y5H5 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC27.53■■■□□ 2
PCDHA9Q9Y5H5 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
PCDHA9Q9Y5H5 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
PCDHA9Q9Y5H5 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
PCDHA9Q9Y5H5 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PCDHA9Q9Y5H5 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PCDHA9Q9Y5H5 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PCDHA9Q9Y5H5 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PCDHA9Q9Y5H5 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PCDHA9Q9Y5H5 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PCDHA9Q9Y5H5 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PCDHA9Q9Y5H5 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PCDHA9Q9Y5H5 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PCDHA9Q9Y5H5 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PCDHA9Q9Y5H5 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PCDHA9Q9Y5H5 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PCDHA9Q9Y5H5 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PCDHA9Q9Y5H5 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PCDHA9Q9Y5H5 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PCDHA9Q9Y5H5 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PCDHA9Q9Y5H5 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
PCDHA9Q9Y5H5 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PCDHA9Q9Y5H5 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PCDHA9Q9Y5H5 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PCDHA9Q9Y5H5 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PCDHA9Q9Y5H5 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PCDHA9Q9Y5H5 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PCDHA9Q9Y5H5 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PCDHA9Q9Y5H5 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PCDHA9Q9Y5H5 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PCDHA9Q9Y5H5 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PCDHA9Q9Y5H5 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
PCDHA9Q9Y5H5 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PCDHA9Q9Y5H5 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PCDHA9Q9Y5H5 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PCDHA9Q9Y5H5 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PCDHA9Q9Y5H5 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PCDHA9Q9Y5H5 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PCDHA9Q9Y5H5 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PCDHA9Q9Y5H5 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PCDHA9Q9Y5H5 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PCDHA9Q9Y5H5 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PCDHA9Q9Y5H5 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PCDHA9Q9Y5H5 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PCDHA9Q9Y5H5 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PCDHA9Q9Y5H5 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PCDHA9Q9Y5H5 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PCDHA9Q9Y5H5 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PCDHA9Q9Y5H5 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PCDHA9Q9Y5H5 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PCDHA9Q9Y5H5 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PCDHA9Q9Y5H5 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PCDHA9Q9Y5H5 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PCDHA9Q9Y5H5 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PCDHA9Q9Y5H5 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PCDHA9Q9Y5H5 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PCDHA9Q9Y5H5 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PCDHA9Q9Y5H5 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PCDHA9Q9Y5H5 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
PCDHA9Q9Y5H5 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
PCDHA9Q9Y5H5 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PCDHA9Q9Y5H5 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PCDHA9Q9Y5H5 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PCDHA9Q9Y5H5 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PCDHA9Q9Y5H5 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PCDHA9Q9Y5H5 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
PCDHA9Q9Y5H5 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PCDHA9Q9Y5H5 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PCDHA9Q9Y5H5 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PCDHA9Q9Y5H5 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PCDHA9Q9Y5H5 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PCDHA9Q9Y5H5 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PCDHA9Q9Y5H5 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PCDHA9Q9Y5H5 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PCDHA9Q9Y5H5 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PCDHA9Q9Y5H5 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PCDHA9Q9Y5H5 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
PCDHA9Q9Y5H5 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PCDHA9Q9Y5H5 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PCDHA9Q9Y5H5 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PCDHA9Q9Y5H5 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PCDHA9Q9Y5H5 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PCDHA9Q9Y5H5 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PCDHA9Q9Y5H5 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PCDHA9Q9Y5H5 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PCDHA9Q9Y5H5 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
PCDHA9Q9Y5H5 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
PCDHA9Q9Y5H5 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms