Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4Z0

LSM4, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSM4Q9Y4Z0 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LSM4Q9Y4Z0 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LSM4Q9Y4Z0 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LSM4Q9Y4Z0 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LSM4Q9Y4Z0 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LSM4Q9Y4Z0 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LSM4Q9Y4Z0 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
LSM4Q9Y4Z0 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LSM4Q9Y4Z0 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LSM4Q9Y4Z0 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LSM4Q9Y4Z0 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LSM4Q9Y4Z0 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LSM4Q9Y4Z0 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LSM4Q9Y4Z0 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LSM4Q9Y4Z0 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LSM4Q9Y4Z0 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LSM4Q9Y4Z0 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LSM4Q9Y4Z0 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LSM4Q9Y4Z0 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LSM4Q9Y4Z0 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LSM4Q9Y4Z0 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LSM4Q9Y4Z0 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LSM4Q9Y4Z0 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LSM4Q9Y4Z0 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LSM4Q9Y4Z0 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LSM4Q9Y4Z0 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LSM4Q9Y4Z0 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LSM4Q9Y4Z0 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LSM4Q9Y4Z0 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LSM4Q9Y4Z0 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
LSM4Q9Y4Z0 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LSM4Q9Y4Z0 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LSM4Q9Y4Z0 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LSM4Q9Y4Z0 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LSM4Q9Y4Z0 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LSM4Q9Y4Z0 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LSM4Q9Y4Z0 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LSM4Q9Y4Z0 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LSM4Q9Y4Z0 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LSM4Q9Y4Z0 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LSM4Q9Y4Z0 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LSM4Q9Y4Z0 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LSM4Q9Y4Z0 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LSM4Q9Y4Z0 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LSM4Q9Y4Z0 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LSM4Q9Y4Z0 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LSM4Q9Y4Z0 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LSM4Q9Y4Z0 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
LSM4Q9Y4Z0 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LSM4Q9Y4Z0 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LSM4Q9Y4Z0 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LSM4Q9Y4Z0 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LSM4Q9Y4Z0 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LSM4Q9Y4Z0 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LSM4Q9Y4Z0 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LSM4Q9Y4Z0 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LSM4Q9Y4Z0 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LSM4Q9Y4Z0 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LSM4Q9Y4Z0 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LSM4Q9Y4Z0 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LSM4Q9Y4Z0 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LSM4Q9Y4Z0 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
LSM4Q9Y4Z0 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LSM4Q9Y4Z0 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LSM4Q9Y4Z0 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LSM4Q9Y4Z0 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LSM4Q9Y4Z0 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LSM4Q9Y4Z0 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LSM4Q9Y4Z0 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LSM4Q9Y4Z0 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LSM4Q9Y4Z0 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LSM4Q9Y4Z0 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LSM4Q9Y4Z0 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LSM4Q9Y4Z0 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LSM4Q9Y4Z0 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LSM4Q9Y4Z0 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LSM4Q9Y4Z0 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LSM4Q9Y4Z0 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LSM4Q9Y4Z0 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LSM4Q9Y4Z0 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LSM4Q9Y4Z0 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LSM4Q9Y4Z0 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LSM4Q9Y4Z0 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LSM4Q9Y4Z0 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LSM4Q9Y4Z0 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LSM4Q9Y4Z0 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LSM4Q9Y4Z0 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LSM4Q9Y4Z0 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LSM4Q9Y4Z0 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LSM4Q9Y4Z0 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LSM4Q9Y4Z0 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LSM4Q9Y4Z0 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LSM4Q9Y4Z0 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LSM4Q9Y4Z0 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
LSM4Q9Y4Z0 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LSM4Q9Y4Z0 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LSM4Q9Y4Z0 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LSM4Q9Y4Z0 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LSM4Q9Y4Z0 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LSM4Q9Y4Z0 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms