Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKS6

PACSIN3, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3Q9UKS6 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PACSIN3Q9UKS6 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PACSIN3Q9UKS6 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PACSIN3Q9UKS6 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PACSIN3Q9UKS6 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PACSIN3Q9UKS6 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PACSIN3Q9UKS6 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PACSIN3Q9UKS6 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PACSIN3Q9UKS6 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PACSIN3Q9UKS6 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PACSIN3Q9UKS6 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PACSIN3Q9UKS6 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PACSIN3Q9UKS6 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PACSIN3Q9UKS6 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PACSIN3Q9UKS6 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PACSIN3Q9UKS6 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PACSIN3Q9UKS6 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PACSIN3Q9UKS6 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PACSIN3Q9UKS6 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PACSIN3Q9UKS6 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PACSIN3Q9UKS6 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PACSIN3Q9UKS6 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
PACSIN3Q9UKS6 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PACSIN3Q9UKS6 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PACSIN3Q9UKS6 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PACSIN3Q9UKS6 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PACSIN3Q9UKS6 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PACSIN3Q9UKS6 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC27.53■■■□□ 2
PACSIN3Q9UKS6 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
PACSIN3Q9UKS6 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PACSIN3Q9UKS6 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PACSIN3Q9UKS6 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PACSIN3Q9UKS6 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PACSIN3Q9UKS6 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PACSIN3Q9UKS6 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
PACSIN3Q9UKS6 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PACSIN3Q9UKS6 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PACSIN3Q9UKS6 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PACSIN3Q9UKS6 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PACSIN3Q9UKS6 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PACSIN3Q9UKS6 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PACSIN3Q9UKS6 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PACSIN3Q9UKS6 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PACSIN3Q9UKS6 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PACSIN3Q9UKS6 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PACSIN3Q9UKS6 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PACSIN3Q9UKS6 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PACSIN3Q9UKS6 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PACSIN3Q9UKS6 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PACSIN3Q9UKS6 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PACSIN3Q9UKS6 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.96
PACSIN3Q9UKS6 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PACSIN3Q9UKS6 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PACSIN3Q9UKS6 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PACSIN3Q9UKS6 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PACSIN3Q9UKS6 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PACSIN3Q9UKS6 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PACSIN3Q9UKS6 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PACSIN3Q9UKS6 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PACSIN3Q9UKS6 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PACSIN3Q9UKS6 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PACSIN3Q9UKS6 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PACSIN3Q9UKS6 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PACSIN3Q9UKS6 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PACSIN3Q9UKS6 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PACSIN3Q9UKS6 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PACSIN3Q9UKS6 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PACSIN3Q9UKS6 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PACSIN3Q9UKS6 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PACSIN3Q9UKS6 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PACSIN3Q9UKS6 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PACSIN3Q9UKS6 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PACSIN3Q9UKS6 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PACSIN3Q9UKS6 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PACSIN3Q9UKS6 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PACSIN3Q9UKS6 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PACSIN3Q9UKS6 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PACSIN3Q9UKS6 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PACSIN3Q9UKS6 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PACSIN3Q9UKS6 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
PACSIN3Q9UKS6 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PACSIN3Q9UKS6 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PACSIN3Q9UKS6 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PACSIN3Q9UKS6 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PACSIN3Q9UKS6 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PACSIN3Q9UKS6 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PACSIN3Q9UKS6 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PACSIN3Q9UKS6 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
PACSIN3Q9UKS6 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
PACSIN3Q9UKS6 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PACSIN3Q9UKS6 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PACSIN3Q9UKS6 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PACSIN3Q9UKS6 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PACSIN3Q9UKS6 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PACSIN3Q9UKS6 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
PACSIN3Q9UKS6 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PACSIN3Q9UKS6 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PACSIN3Q9UKS6 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PACSIN3Q9UKS6 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PACSIN3Q9UKS6 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms