Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH64

CDKN2A-AS1, Susceptibility protein NSG-x, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN2A-AS1Q9UH64 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CDKN2A-AS1Q9UH64 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CDKN2A-AS1Q9UH64 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CDKN2A-AS1Q9UH64 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CDKN2A-AS1Q9UH64 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CDKN2A-AS1Q9UH64 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
CDKN2A-AS1Q9UH64 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CDKN2A-AS1Q9UH64 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CDKN2A-AS1Q9UH64 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CDKN2A-AS1Q9UH64 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CDKN2A-AS1Q9UH64 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CDKN2A-AS1Q9UH64 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CDKN2A-AS1Q9UH64 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CDKN2A-AS1Q9UH64 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CDKN2A-AS1Q9UH64 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CDKN2A-AS1Q9UH64 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CDKN2A-AS1Q9UH64 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CDKN2A-AS1Q9UH64 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CDKN2A-AS1Q9UH64 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CDKN2A-AS1Q9UH64 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CDKN2A-AS1Q9UH64 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CDKN2A-AS1Q9UH64 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CDKN2A-AS1Q9UH64 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CDKN2A-AS1Q9UH64 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CDKN2A-AS1Q9UH64 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CDKN2A-AS1Q9UH64 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CDKN2A-AS1Q9UH64 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CDKN2A-AS1Q9UH64 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CDKN2A-AS1Q9UH64 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CDKN2A-AS1Q9UH64 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDKN2A-AS1Q9UH64 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDKN2A-AS1Q9UH64 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDKN2A-AS1Q9UH64 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDKN2A-AS1Q9UH64 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDKN2A-AS1Q9UH64 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDKN2A-AS1Q9UH64 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDKN2A-AS1Q9UH64 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDKN2A-AS1Q9UH64 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDKN2A-AS1Q9UH64 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDKN2A-AS1Q9UH64 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CDKN2A-AS1Q9UH64 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CDKN2A-AS1Q9UH64 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CDKN2A-AS1Q9UH64 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CDKN2A-AS1Q9UH64 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CDKN2A-AS1Q9UH64 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CDKN2A-AS1Q9UH64 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CDKN2A-AS1Q9UH64 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CDKN2A-AS1Q9UH64 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CDKN2A-AS1Q9UH64 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CDKN2A-AS1Q9UH64 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CDKN2A-AS1Q9UH64 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CDKN2A-AS1Q9UH64 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CDKN2A-AS1Q9UH64 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CDKN2A-AS1Q9UH64 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CDKN2A-AS1Q9UH64 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CDKN2A-AS1Q9UH64 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CDKN2A-AS1Q9UH64 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CDKN2A-AS1Q9UH64 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CDKN2A-AS1Q9UH64 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CDKN2A-AS1Q9UH64 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CDKN2A-AS1Q9UH64 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CDKN2A-AS1Q9UH64 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDKN2A-AS1Q9UH64 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDKN2A-AS1Q9UH64 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDKN2A-AS1Q9UH64 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDKN2A-AS1Q9UH64 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDKN2A-AS1Q9UH64 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDKN2A-AS1Q9UH64 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDKN2A-AS1Q9UH64 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDKN2A-AS1Q9UH64 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CDKN2A-AS1Q9UH64 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CDKN2A-AS1Q9UH64 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CDKN2A-AS1Q9UH64 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CDKN2A-AS1Q9UH64 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CDKN2A-AS1Q9UH64 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CDKN2A-AS1Q9UH64 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CDKN2A-AS1Q9UH64 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CDKN2A-AS1Q9UH64 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CDKN2A-AS1Q9UH64 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CDKN2A-AS1Q9UH64 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CDKN2A-AS1Q9UH64 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CDKN2A-AS1Q9UH64 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CDKN2A-AS1Q9UH64 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CDKN2A-AS1Q9UH64 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CDKN2A-AS1Q9UH64 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDKN2A-AS1Q9UH64 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDKN2A-AS1Q9UH64 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDKN2A-AS1Q9UH64 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDKN2A-AS1Q9UH64 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDKN2A-AS1Q9UH64 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDKN2A-AS1Q9UH64 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDKN2A-AS1Q9UH64 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDKN2A-AS1Q9UH64 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDKN2A-AS1Q9UH64 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDKN2A-AS1Q9UH64 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDKN2A-AS1Q9UH64 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CDKN2A-AS1Q9UH64 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CDKN2A-AS1Q9UH64 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDKN2A-AS1Q9UH64 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDKN2A-AS1Q9UH64 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms