Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2I0

CPSF2, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPSF2Q9P2I0 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CPSF2Q9P2I0 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CPSF2Q9P2I0 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CPSF2Q9P2I0 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CPSF2Q9P2I0 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CPSF2Q9P2I0 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CPSF2Q9P2I0 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CPSF2Q9P2I0 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CPSF2Q9P2I0 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CPSF2Q9P2I0 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CPSF2Q9P2I0 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CPSF2Q9P2I0 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CPSF2Q9P2I0 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CPSF2Q9P2I0 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CPSF2Q9P2I0 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CPSF2Q9P2I0 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
CPSF2Q9P2I0 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CPSF2Q9P2I0 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CPSF2Q9P2I0 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CPSF2Q9P2I0 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CPSF2Q9P2I0 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CPSF2Q9P2I0 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CPSF2Q9P2I0 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CPSF2Q9P2I0 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CPSF2Q9P2I0 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CPSF2Q9P2I0 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CPSF2Q9P2I0 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CPSF2Q9P2I0 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CPSF2Q9P2I0 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CPSF2Q9P2I0 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CPSF2Q9P2I0 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CPSF2Q9P2I0 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CPSF2Q9P2I0 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CPSF2Q9P2I0 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CPSF2Q9P2I0 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CPSF2Q9P2I0 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CPSF2Q9P2I0 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CPSF2Q9P2I0 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CPSF2Q9P2I0 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CPSF2Q9P2I0 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CPSF2Q9P2I0 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CPSF2Q9P2I0 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CPSF2Q9P2I0 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CPSF2Q9P2I0 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CPSF2Q9P2I0 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
CPSF2Q9P2I0 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
CPSF2Q9P2I0 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
CPSF2Q9P2I0 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CPSF2Q9P2I0 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CPSF2Q9P2I0 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CPSF2Q9P2I0 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CPSF2Q9P2I0 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CPSF2Q9P2I0 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CPSF2Q9P2I0 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CPSF2Q9P2I0 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CPSF2Q9P2I0 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CPSF2Q9P2I0 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CPSF2Q9P2I0 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CPSF2Q9P2I0 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CPSF2Q9P2I0 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CPSF2Q9P2I0 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CPSF2Q9P2I0 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CPSF2Q9P2I0 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CPSF2Q9P2I0 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CPSF2Q9P2I0 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
CPSF2Q9P2I0 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CPSF2Q9P2I0 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CPSF2Q9P2I0 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CPSF2Q9P2I0 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CPSF2Q9P2I0 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CPSF2Q9P2I0 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CPSF2Q9P2I0 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CPSF2Q9P2I0 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CPSF2Q9P2I0 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CPSF2Q9P2I0 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CPSF2Q9P2I0 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CPSF2Q9P2I0 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CPSF2Q9P2I0 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CPSF2Q9P2I0 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CPSF2Q9P2I0 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CPSF2Q9P2I0 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CPSF2Q9P2I0 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CPSF2Q9P2I0 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CPSF2Q9P2I0 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CPSF2Q9P2I0 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CPSF2Q9P2I0 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CPSF2Q9P2I0 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CPSF2Q9P2I0 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CPSF2Q9P2I0 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CPSF2Q9P2I0 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CPSF2Q9P2I0 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CPSF2Q9P2I0 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CPSF2Q9P2I0 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CPSF2Q9P2I0 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CPSF2Q9P2I0 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CPSF2Q9P2I0 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CPSF2Q9P2I0 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CPSF2Q9P2I0 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CPSF2Q9P2I0 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CPSF2Q9P2I0 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms