Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV44

LINC00846, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00846, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00846Q9NV44 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LINC00846Q9NV44 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LINC00846Q9NV44 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LINC00846Q9NV44 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LINC00846Q9NV44 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LINC00846Q9NV44 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LINC00846Q9NV44 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LINC00846Q9NV44 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
LINC00846Q9NV44 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LINC00846Q9NV44 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LINC00846Q9NV44 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LINC00846Q9NV44 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LINC00846Q9NV44 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LINC00846Q9NV44 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LINC00846Q9NV44 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LINC00846Q9NV44 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LINC00846Q9NV44 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LINC00846Q9NV44 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LINC00846Q9NV44 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LINC00846Q9NV44 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LINC00846Q9NV44 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LINC00846Q9NV44 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC00846Q9NV44 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LINC00846Q9NV44 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LINC00846Q9NV44 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LINC00846Q9NV44 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LINC00846Q9NV44 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LINC00846Q9NV44 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LINC00846Q9NV44 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LINC00846Q9NV44 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LINC00846Q9NV44 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC00846Q9NV44 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC00846Q9NV44 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC00846Q9NV44 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC00846Q9NV44 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC00846Q9NV44 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC00846Q9NV44 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC00846Q9NV44 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC00846Q9NV44 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC00846Q9NV44 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC00846Q9NV44 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC00846Q9NV44 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LINC00846Q9NV44 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC00846Q9NV44 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC00846Q9NV44 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LINC00846Q9NV44 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LINC00846Q9NV44 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LINC00846Q9NV44 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LINC00846Q9NV44 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC00846Q9NV44 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LINC00846Q9NV44 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
LINC00846Q9NV44 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LINC00846Q9NV44 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LINC00846Q9NV44 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LINC00846Q9NV44 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LINC00846Q9NV44 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LINC00846Q9NV44 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LINC00846Q9NV44 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
LINC00846Q9NV44 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LINC00846Q9NV44 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LINC00846Q9NV44 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LINC00846Q9NV44 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LINC00846Q9NV44 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LINC00846Q9NV44 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LINC00846Q9NV44 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LINC00846Q9NV44 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LINC00846Q9NV44 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LINC00846Q9NV44 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LINC00846Q9NV44 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LINC00846Q9NV44 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LINC00846Q9NV44 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LINC00846Q9NV44 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LINC00846Q9NV44 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
LINC00846Q9NV44 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LINC00846Q9NV44 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LINC00846Q9NV44 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LINC00846Q9NV44 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LINC00846Q9NV44 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LINC00846Q9NV44 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LINC00846Q9NV44 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LINC00846Q9NV44 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LINC00846Q9NV44 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
LINC00846Q9NV44 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LINC00846Q9NV44 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LINC00846Q9NV44 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LINC00846Q9NV44 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LINC00846Q9NV44 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LINC00846Q9NV44 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LINC00846Q9NV44 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LINC00846Q9NV44 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LINC00846Q9NV44 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LINC00846Q9NV44 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LINC00846Q9NV44 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LINC00846Q9NV44 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LINC00846Q9NV44 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LINC00846Q9NV44 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LINC00846Q9NV44 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LINC00846Q9NV44 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LINC00846Q9NV44 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LINC00846Q9NV44 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms