Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSD4

ZNF275, Zinc finger protein 275, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF275Q9NSD4 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
ZNF275Q9NSD4 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZNF275Q9NSD4 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZNF275Q9NSD4 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZNF275Q9NSD4 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZNF275Q9NSD4 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZNF275Q9NSD4 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZNF275Q9NSD4 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZNF275Q9NSD4 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZNF275Q9NSD4 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZNF275Q9NSD4 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
ZNF275Q9NSD4 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZNF275Q9NSD4 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZNF275Q9NSD4 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZNF275Q9NSD4 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZNF275Q9NSD4 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZNF275Q9NSD4 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZNF275Q9NSD4 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZNF275Q9NSD4 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZNF275Q9NSD4 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZNF275Q9NSD4 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZNF275Q9NSD4 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZNF275Q9NSD4 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZNF275Q9NSD4 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ZNF275Q9NSD4 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZNF275Q9NSD4 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZNF275Q9NSD4 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZNF275Q9NSD4 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZNF275Q9NSD4 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZNF275Q9NSD4 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZNF275Q9NSD4 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZNF275Q9NSD4 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZNF275Q9NSD4 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZNF275Q9NSD4 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZNF275Q9NSD4 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZNF275Q9NSD4 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZNF275Q9NSD4 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZNF275Q9NSD4 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZNF275Q9NSD4 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZNF275Q9NSD4 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZNF275Q9NSD4 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZNF275Q9NSD4 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZNF275Q9NSD4 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZNF275Q9NSD4 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZNF275Q9NSD4 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ZNF275Q9NSD4 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZNF275Q9NSD4 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZNF275Q9NSD4 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZNF275Q9NSD4 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZNF275Q9NSD4 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZNF275Q9NSD4 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZNF275Q9NSD4 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZNF275Q9NSD4 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZNF275Q9NSD4 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ZNF275Q9NSD4 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ZNF275Q9NSD4 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZNF275Q9NSD4 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
ZNF275Q9NSD4 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZNF275Q9NSD4 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZNF275Q9NSD4 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZNF275Q9NSD4 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZNF275Q9NSD4 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZNF275Q9NSD4 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZNF275Q9NSD4 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZNF275Q9NSD4 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZNF275Q9NSD4 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZNF275Q9NSD4 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZNF275Q9NSD4 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZNF275Q9NSD4 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZNF275Q9NSD4 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
ZNF275Q9NSD4 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZNF275Q9NSD4 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZNF275Q9NSD4 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZNF275Q9NSD4 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZNF275Q9NSD4 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZNF275Q9NSD4 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZNF275Q9NSD4 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZNF275Q9NSD4 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZNF275Q9NSD4 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZNF275Q9NSD4 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZNF275Q9NSD4 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZNF275Q9NSD4 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZNF275Q9NSD4 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ZNF275Q9NSD4 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ZNF275Q9NSD4 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ZNF275Q9NSD4 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNF275Q9NSD4 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF275Q9NSD4 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF275Q9NSD4 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNF275Q9NSD4 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZNF275Q9NSD4 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZNF275Q9NSD4 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZNF275Q9NSD4 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZNF275Q9NSD4 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZNF275Q9NSD4 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZNF275Q9NSD4 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZNF275Q9NSD4 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF275Q9NSD4 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF275Q9NSD4 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZNF275Q9NSD4 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.2 ms