Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR19

ACSS2, Acetyl-coenzyme A synthetase, cytoplasmic, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSS2Q9NR19 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ACSS2Q9NR19 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ACSS2Q9NR19 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ACSS2Q9NR19 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ACSS2Q9NR19 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
ACSS2Q9NR19 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ACSS2Q9NR19 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ACSS2Q9NR19 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ACSS2Q9NR19 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ACSS2Q9NR19 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ACSS2Q9NR19 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ACSS2Q9NR19 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ACSS2Q9NR19 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ACSS2Q9NR19 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ACSS2Q9NR19 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ACSS2Q9NR19 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ACSS2Q9NR19 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ACSS2Q9NR19 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ACSS2Q9NR19 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ACSS2Q9NR19 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ACSS2Q9NR19 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ACSS2Q9NR19 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ACSS2Q9NR19 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ACSS2Q9NR19 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ACSS2Q9NR19 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ACSS2Q9NR19 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ACSS2Q9NR19 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ACSS2Q9NR19 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ACSS2Q9NR19 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ACSS2Q9NR19 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ACSS2Q9NR19 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ACSS2Q9NR19 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ACSS2Q9NR19 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ACSS2Q9NR19 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ACSS2Q9NR19 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ACSS2Q9NR19 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ACSS2Q9NR19 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ACSS2Q9NR19 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
ACSS2Q9NR19 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ACSS2Q9NR19 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
ACSS2Q9NR19 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ACSS2Q9NR19 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
ACSS2Q9NR19 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ACSS2Q9NR19 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ACSS2Q9NR19 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ACSS2Q9NR19 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ACSS2Q9NR19 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ACSS2Q9NR19 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ACSS2Q9NR19 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ACSS2Q9NR19 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ACSS2Q9NR19 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ACSS2Q9NR19 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ACSS2Q9NR19 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ACSS2Q9NR19 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ACSS2Q9NR19 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ACSS2Q9NR19 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ACSS2Q9NR19 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ACSS2Q9NR19 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ACSS2Q9NR19 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ACSS2Q9NR19 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ACSS2Q9NR19 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ACSS2Q9NR19 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ACSS2Q9NR19 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ACSS2Q9NR19 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ACSS2Q9NR19 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ACSS2Q9NR19 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ACSS2Q9NR19 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ACSS2Q9NR19 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ACSS2Q9NR19 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ACSS2Q9NR19 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ACSS2Q9NR19 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ACSS2Q9NR19 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ACSS2Q9NR19 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ACSS2Q9NR19 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ACSS2Q9NR19 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ACSS2Q9NR19 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ACSS2Q9NR19 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ACSS2Q9NR19 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ACSS2Q9NR19 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ACSS2Q9NR19 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ACSS2Q9NR19 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ACSS2Q9NR19 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ACSS2Q9NR19 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ACSS2Q9NR19 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ACSS2Q9NR19 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ACSS2Q9NR19 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ACSS2Q9NR19 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ACSS2Q9NR19 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ACSS2Q9NR19 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ACSS2Q9NR19 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ACSS2Q9NR19 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ACSS2Q9NR19 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ACSS2Q9NR19 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ACSS2Q9NR19 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ACSS2Q9NR19 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ACSS2Q9NR19 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ACSS2Q9NR19 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ACSS2Q9NR19 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ACSS2Q9NR19 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ACSS2Q9NR19 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms